真菌是一種微生物，亦可稱霉菌。往昔認為它系屬于一類低等植物。嗣后，鑒于真菌既不含葉綠素，又沒有根、莖、葉之分，故當今傾向于從植物中分離出來。但目前，關于真菌在生物界中的地位和起源問題，意見尚有分岐。有人主張，真菌可以和動物、植物相并立為所謂第三界，即真菌界。
真菌界可分成真菌門和粘菌門二大類。所謂真菌門便是平時說的真菌。它又可劃分為鞭毛菌、接合菌、擔子菌、子囊及半知菌等五個亞門，而其中半知菌亞門與醫(yī)學聯系最密切，因該亞門是產生疾病最多的菌種。
真菌的基本結構是孢子和菌絲。孢子是繁殖器官，而菌絲則為生長器官。孢子又分無性孢子和有性孢子；菌絲自身有分隔的，也可不分隔。由此可見，真菌主要是通過孢子進行無性或有性繁殖。在適宜環(huán)境中，自孢子發(fā)芽發(fā)展成菌絲，從菌絲未端再長出孢子，如此循環(huán)不已、而不斷繁殖后代。
真菌種類十分復雜，在自然界里，大約有十幾萬種，但大多數是不致病的。然而有些真菌又成為各種動植物的病原菌。據估計有100種左右的真菌可引起人類發(fā)病。這種可致病的真菌，則稱為致病真菌；而不產生疾病，如夏天可招引食物發(fā)霉的真菌謂之污染菌。但污染菌，象青霉菌、曲菌等在條件適宜時，也可引發(fā)疾病。
所謂真菌病乃由于人類感染致病真菌而發(fā)生的疾病。一般按其侵犯部位不同將真菌病分為淺部真菌病和深部真菌病兩大類：侵犯表皮，毛發(fā)和甲的稱為淺部真菌��；侵犯皮下組織和內臟器官的叫做深部真菌病。此外，還有少數真菌，如念球菌，則皮膚和內臟皆可累及。
