D因子是啟動替代途徑激活的重要成分，為由222個(gè)氨基酸殘基組成的單鏈絲氨酸蛋白酶，分子量僅25kDa。D因子在血清中的濃度很低（1-2μg/ml)，主要以活化形式而存在。但可能還有一種以酶原形式而存在的由239個(gè)氨基酸殘基組成的D因子。具有活性的D因子（D)可能在第234-235位的精氨酸-賴氨酸鍵處將B因子裂解為Ba和Bb兩個(gè)片段，從而啟動替代途徑的級聯(lián)活化反應(yīng)。D因子的部分cDNA已克隆成功，并進(jìn)行了序列分析，發(fā)現(xiàn)其與其它幾種絲氨酸蛋白酶（如胰蛋白酶、糜蛋白酶、纖溶酶及弱性蛋白酶)具有同源性。
