在1ac操縱元的啟動子P1ac上游端有一段與Plac部分重疊的序列,能與CAP特異結合,稱為CAP結合位點(CAp binding site)。CAP與這段序列結合時,可增強RNA聚合酶的轉錄活性,使轉錄提高50倍。相反,當有葡萄糖可供分解利用時,cAMP濃度降低,CRP不能被活化,1ac操縱元的結構基因表達下降。
圖19-9 葡萄糖利用對乳糖操縱元的影響
由于P1ac是弱啟動子,單純因乳糖的存在發(fā)生去阻遏使1ac操縱元轉錄開放,還不能使細胞很好利用乳糖,必須同時有CAP來加強轉錄活性,細菌才能合成足夠的酶來利用乳糖。1ac操縱元的強誘導既需要有乳糖的存在,又需要沒有葡萄糖可供利用。通過這種機制,細菌優(yōu)先利用環(huán)境中的葡萄糖,只有無葡萄糖而又有乳糖時,細菌才去充分利用乳糖。
細菌對葡萄糖以外的其他糖(如阿拉伯糖、半乳糖、麥芽糖等)的利用上也有類似對乳糖利的情況,在含有編碼利用阿拉伯糖的酶類基因群的阿拉伯糖操縱元(ara operon)、半乳糖操縱元(gal operon)中也有CAP結合位點,CAP也起類似的正性調控作用。所以CAP的通用名稱是分解代謝基因激活蛋白(catabolic gene activator protein)。
不難看出:CAP結合位點就是一種起正性調控作用的操縱子,CAP則是對轉錄起正性作用的控蛋白棗激活蛋白,編碼CRP的基因也是一個調控基因,不過它并不在1ac操縱元的附近,CAP可以對幾個操縱元都起作用。
從上所述,乳糖操縱元屬于可誘導操縱元(inducible operon),這類操縱元通常是關閉的,當受效應物作用后誘導開放轉錄。這類操縱元使細菌能適應環(huán)境的變化,最有效地利用環(huán)境能提供的能源底物。
四、色氨酸操縱元
色氨酸是構成蛋白質的組分,一般的環(huán)境難以給細菌提供足夠的色氨酸,細菌要生存繁殖通常需要自己經(jīng)過許多步驟合成色氨酸,但是一旦環(huán)境能夠提供色氨酸時,細菌就會充分利用外界的色氨酸、減少或停止合成色氨酸,以減輕自己的負擔。細菌所以能做到這點是因為有色氨酸操縱元(trp operon)的調控。
(一)色氨酸操縱元的結構與阻遏蛋白的負性調控
如圖19-10所示,合成色氨酸所需要酶類的基因E、D、C、B、A等頭尾相接串連排列組成結構基因群,受其上游的啟動子Ptrp和操縱子o的調控,調控基因trpR的位置遠離P-o-結構基因群,在其自身的啟動子作用下,以組成性方式低水平表達分子量為47000的調控蛋白R。R并沒有與o結合的活性,當環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時,R與色氨酸結合后構象變化而活化,就能夠與o特異性親和結合,阻遏結構基因的轉錄,因此這是屬于一種負性調控的、可阻遏的操縱元(repressible operon),即這操縱元通常是開放轉錄的,當有效應物(色氨酸為阻遏劑)作用時,則阻遏關閉轉錄。細菌不少生物合成系統(tǒng)的操縱元都屬于這種類型,其調控可使細菌處在生存繁殖最經(jīng)濟最節(jié)省的狀態(tài)。
圖19-10 色氨酸操縱元的結構和調控示意圖
(二)衰減子及其作用
實驗觀察表明:當色氨酸達到一定濃度,但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時,產生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產生的酶量與色氨酸濃度呈負相關。仔細研究發(fā)現(xiàn)這種調控現(xiàn)象與色氨酸操縱元特殊的結構有關。醫(yī)學全在線www.med126.com
圖19-11 色氨酸操縱元中的衰減子結構及其調控示意圖
在色氨酸操縱元Ptrp-o與第一個結構基因trpE之間有162bp的一段先導序列(leadingsequence,L)實驗證明當色氨酸達一定濃度時,RNA聚合酶的轉錄會終止在這里。這段序列中含有編碼由14個氨基酸組成的短肽的開放讀框,其序列中有2個色氨酸相連,在此開放讀框前有核糖體識別結合位點(RBS)序列,提示這段短開放讀框在轉錄后是能被翻譯的。在先導序列的后半段含有3對反向重復序列(圖19?1中A、B及C),在被轉錄生成mRNA時都能夠形成發(fā)夾式結構,但由于B的序列分別與A和C重疊,所以如果B形成發(fā)夾結構,A和C都不能再形成發(fā)夾結構;相反,當A形成發(fā)夾結構時,B就不能形成發(fā)夾結構,卻有利于C生成發(fā)夾結構。C后面緊跟一串A(轉錄成RNA就是一串U),C實際上是一個終止子,如果轉錄mRNA時它形成發(fā)夾結構,就能使RNA聚合酶停止轉錄而從mRNA上脫離下來。
圖19-12 三種不同情況下A、B、C形成發(fā)夾結構的狀態(tài)
在色氨酸未達到能起阻遏作用的濃度時,從Ptrp起始轉錄,RNA聚合酶沿DNA轉錄合成mRNA,同時核糖體就結合到新生成的mRNA核糖體結合位點上開始翻譯。當色氨酸濃度低時,生成的tRNAtrp色氨酸量就少,能擴散到核糖體mRNA形成的翻譯復合體中供給合成短肽的幾率低,使核糖體沿mRNA翻譯移動的速度慢,趕不上RNA聚合酶沿DNA移動轉錄的速度,這時核糖體占據(jù)短開放讀框的機會較多,使A不能生成發(fā)夾結構,于是B就形成發(fā)夾結構,阻止了C生成終止信號的結構,RNA聚合酶得以沿DNA前進,繼續(xù)去轉錄其后trpE等基因,trp操縱元就處于開放狀態(tài)。當色氨酸濃度增高時,tRNAtrp色氨酸濃度隨之升高,核糖體沿mRNA翻譯移動的速度加快,占據(jù)到B段的機會增加,B生成發(fā)夾結構的機會減少,C形成終止結構的機會增多,RNA聚合酶終止轉錄的的幾率增加,于是轉錄減弱。如果當其他氨基酸短缺(注意:短開放讀框編碼的14肽中多數(shù)氨基酸能由環(huán)境充分供應的機會是不多的)或所有的氨基酸都不足時,核糖體翻譯移動的速度就更慢,甚至不能占據(jù)A的序列,結果有利于A和C發(fā)夾結構的形成,于是RNA聚合酶停止轉錄,等于告訴細菌:“整個氨基酸都不足,即使合成色氨酸也不能合成蛋白質,不如不合成以節(jié)省能量”。
由此可見,先導序列起到隨色氨酸濃度升高降低轉錄的作用,這段序列就稱為衰減子attenuator)。在trp操縱元中,對結構基因的轉錄阻遏蛋白的負調控起到粗調的作用,而衰減子起到細調的作用。細菌其他氨基酸合成系統(tǒng)的許多操縱元(如組氨酸、蘇氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸等操縱元)中也有類似的衰減子存在。