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真核基因表達調(diào)控

 

 、谏嫌螁幼釉(upstream promoter element) 包括通常位于-70bp附近的CAAT盒和GC盒、以及距轉(zhuǎn)錄起始點更遠的上游元件。這些元件與相應的蛋白因子結合能提高或改變轉(zhuǎn)錄效率。不同基因具有不同的上游啟動子元件,其位置也不相同,這使得不同的基因表達分別有不同的調(diào)控。圖19-14以人金屬硫蛋白基因為例子,說明真核基因上游啟動子元件的組織情況和各元件相應結合的轉(zhuǎn)錄因子。

圖19-14 人金屬硫蛋白基因的調(diào)控區(qū)

  2.增強子 是一種能夠提高轉(zhuǎn)錄效率的順式調(diào)控元件,最早是在SV40病毒中發(fā)現(xiàn)的長約200bp的一段DNA,可使旁側(cè)的基因轉(zhuǎn)錄提高100倍,其后在多種真核生物,甚至在原核生物中都發(fā)現(xiàn)了增強子。增強子通常占100-200bp長度,也和啟動子一樣由若干組件構成,基本核心組件常為8-12bp,可以單拷貝或多拷貝串連形式存在。增強子的作用有以下特點:

 、僭鰪娮犹岣咄粭lDNA鏈上基因轉(zhuǎn)錄效率,可以遠距離作用,通?删嚯x1-4kb、個別情況下離開所調(diào)控的基因30kb仍能發(fā)揮作用,而且在基因的上游或下游都能起作用。

  ②增強子作用與其序列的正反方向無關,將增強子方向倒置依然能起作用。而將啟動子倒就不能起作用,可見增強子與啟動子是很不相同的。

 、墼鰪娮右袉幼硬拍馨l(fā)揮作用,沒有啟動子存在,增強子不能表現(xiàn)活性。但增強子對動子沒有嚴格的專一性,同一增強子可以影響不同類型啟動子的轉(zhuǎn)錄。例如當含有增強子的病毒基因組整合入宿主細胞基因組時,能夠增強整合區(qū)附近宿主某些基因的轉(zhuǎn)錄;當增強子隨某些染色體段落移位時,也能提高移到的新位置周圍基因的轉(zhuǎn)錄。使某些癌基因轉(zhuǎn)錄表達增強,可能是腫瘤發(fā)生的因素之一。

 、茉鰪娮拥淖饔脵C理雖然還不明確,但與其他順式調(diào)控元件一樣,必須與特定的蛋白質(zhì)因結合后才能發(fā)揮增強轉(zhuǎn)錄的作用。增強子一般具有組織或細胞特異性,許多增強子只在某些細胞或組織中表現(xiàn)活性,是由這些細胞或組織中具有的特異性蛋白質(zhì)因子所決定的。醫(yī).學 全在.線提供www.med126.com

  3.沉寂子 最早在酵母中發(fā)現(xiàn),以后在T淋巴細胞的T抗原受體基因的轉(zhuǎn)錄和重排中證實這種負調(diào)控順式元件的存在。目前對這種在基因轉(zhuǎn)錄降低或關閉中起作用的序列研究還不多,但從已有的例子看到:沉寂子的作用可不受序列方向的影響,也能遠距離發(fā)揮作用,并可對異源基因的表達起作用。

  (二)反式作用因子(transacting factors)

  以反式作用影響轉(zhuǎn)錄的因子可統(tǒng)稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors, TF)。RNA聚合酶是一種反式作用于轉(zhuǎn)錄的蛋白因子。在真核細胞中RNA聚合酶通常不能單獨發(fā)揮轉(zhuǎn)錄作用,而需要與其他轉(zhuǎn)錄因子共同協(xié)作。與RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ相應的轉(zhuǎn)錄因子分別稱為TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ,對TFⅡ研究最多。表19-2列出真核基因轉(zhuǎn)錄需要基本的TFⅡ。

表19-2 RNA聚合酶Ⅱ的基本轉(zhuǎn)錄因子

轉(zhuǎn)錄因子 分子量(kD) 功能
TBP 30 與TATA盒結合
TFⅡ-B 33 介導RNA聚合酶Ⅱ的結合
TFⅡ-F 30,74 解旋酶
TFⅡ-E 34,37 ATP酶
TFⅡ-H 62,89 解旋酶
TFⅡ-A 12,19,35 穩(wěn)定TFⅡ-D的結合
TFⅡ-I 120 促進TFⅡ-D的結合

  以前認為與TATA盒結合的蛋白因子是TFⅡ-D,后來發(fā)現(xiàn)TFⅡ-D實際包括兩類成分:與TATA盒結合的蛋白是TBP(TATAbox binding protein),是唯一能識別TATA盒并與其結合的轉(zhuǎn)錄因子,是三種RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄時都需要的;其他稱為TBP相關因子(TBPassociated factors TAF),至少包括8種能與TBP緊密結合的因子。轉(zhuǎn)錄前先是TFⅡ-D與TATA盒結合;繼而TFⅡ-B以其C端與TBP-DNA復合體結合,其N端則能與RNA聚合酶Ⅱ親和結合,接著由兩個亞基組成的TFⅡ-F加入裝配,TFⅡ-F能與RNA聚合酶形成復合體,還具有依賴于ATP供給能量的DNA解旋酶活性,能解開前方的DNA雙螺旋,在轉(zhuǎn)錄鏈延伸中起作用。這樣,啟動子序列就與TFⅡ-D、B、F及RNA聚合酶Ⅱ結合形成一個“最低限度”能有轉(zhuǎn)錄功能基礎的轉(zhuǎn)錄前起始復合物(preintitiation complex, PIC),能轉(zhuǎn)錄mRNA。TFⅡ-H是多亞基蛋白復合體,具有依賴于ATP供給能量的DNA解旋酶活性,在轉(zhuǎn)錄鏈延伸中發(fā)揮作用;TFⅡ-E是兩個亞基組成的四聚體,不直接與DNA結合而可能是與TFⅡ-B聯(lián)系,能提高ATP酶的活性;TFⅡ-E和TFⅡ-H的加入就形成完整的轉(zhuǎn)錄復合體(圖19?5),能轉(zhuǎn)錄延伸生成長鏈RNA,TFⅡ-A能穩(wěn)定TFⅡ-D與TATA盒的結合,提高轉(zhuǎn)錄效率,但不是轉(zhuǎn)錄復合體一定需要的。

圖19-15 RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄復合體的形成示意圖

  以上所述是典型的啟動子上轉(zhuǎn)錄復合體的形成,但有的真核啟動子不含TATA盒或不通過TATA盒開始轉(zhuǎn)錄。例如有的無TATA盒的啟動子是靠TFⅡ-I和TFⅡ-D共同組成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄起始復合體開始轉(zhuǎn)錄的。由此可以看到真核轉(zhuǎn)錄起始的復雜性。

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