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一種基于芯片的反義寡核苷酸篩選方法及其用途

公開(kāi)(公告)號(hào) CN1511957A  
公開(kāi)(公告)日 2004.07.14  
申請(qǐng)(專利)號(hào) CN02159415.5  
申請(qǐng)日期 2002.12.31  
專利名稱 一種基于芯片的反義寡核苷酸篩選方法及其用途  
主分類號(hào) C12Q1/68  
分類號(hào) C12Q1/68  
分案原申請(qǐng)?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(qǐng)(專利權(quán))人 中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射醫(yī)學(xué)研究所  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 王升啟;劉韌;陳忠斌;王丹;;孫偶軍;李慎菁  
地址 100850北京市太平路27號(hào)  
頒證日  
國(guó)際申請(qǐng)  
進(jìn)入國(guó)家日期  
專利代理機(jī)構(gòu)  
代理人  
國(guó)省代碼 北京;11  
主權(quán)項(xiàng) 本發(fā)明涉及一種新的基于芯片雜交和原位RNase H切割的反義寡核苷酸篩選方法,其特征在于,通過(guò)將合成并修飾的靶向特定基因的寡核苷酸固定于化學(xué)修飾的固相載體上制備成基因芯片,與放射性同位素或非放射性分子標(biāo)記的信使核糖核酸(mRNA)模板進(jìn)行雜交,雜交結(jié)束后洗去雜交液并晾干,加入RNase H進(jìn)行切割,對(duì)照區(qū)只加緩沖液不加酶,一定時(shí)間后洗滌、晾干并進(jìn)行信號(hào)檢測(cè)掃描,分析各序列結(jié)合靶mRNA強(qiáng)度及RNase H切割活性,以RNase H切割前/切割后的比值進(jìn)行排序,理論上比值越大的序列其結(jié)合活性和RNase H切割活性越好,從而優(yōu)化出具有RNase H激活活性的結(jié)合靶點(diǎn)序列、最佳寡核苷酸長(zhǎng)度及其修飾方法。  
摘要 本發(fā)明涉及一種生物工程類檢測(cè)技術(shù)及其用途。具體說(shuō)是將合成并修飾的靶向特定基因的寡核苷酸固定于化學(xué)修飾的固相載體上制備成基因芯片,與放射性同位素或非放射性分子標(biāo)記的信使核糖核酸(mRNA)模板雜交,雜交結(jié)束后洗去雜交液并晾干,加入RNase H切割,對(duì)照區(qū)只加緩沖液不加酶,一定時(shí)間后洗滌、晾干并進(jìn)行檢測(cè),分析各序列結(jié)合強(qiáng)度及RNase H切割活性,以RNase H切割前/切割后的比值進(jìn)行排序,理論上比值越大的序列其結(jié)合活性和RNase H切割活性越好,優(yōu)化出具有RNase H激活活性的結(jié)合靶點(diǎn)序列、最佳寡核苷酸長(zhǎng)度及其修飾方法。從上述優(yōu)化的序列中選出最佳寡核苷酸序列,(1)通過(guò)體內(nèi)外活性評(píng)價(jià)進(jìn)一步確定其生物活性,獲得寡核苷酸候選藥物;(2)作為疾病診斷的探針;(3)作為基因功能研究的工具。  
國(guó)際公布  
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