孢子蟲隸屬于頂復門(Phylum Apicomplex)的孢子綱(Class Sporozoa)。全為寄生性。細胞內寄生階段一般無運動細胞器,如有偽足則是攝食作用。生殖方式包括無性和有性兩類。無性生殖有裂體增殖(schizogony)產生裂殖子,以及孢子增殖(sporogony)產生具感染性的子孢子(sporozoite);有性生殖是通過雌雄配子結合進行的配子生殖(gametogony)。以上兩種生殖方式或可在一個宿主或分別在兩個宿主體內完成,有或無宿主更換。