編碼T細(xì)胞受體(T cell receptor,TCR)α、β、γ和δ鏈的基因定位于不同的染色體(表3-6)。人和小鼠δ基因都位于α基因的復(fù)合體中,均位于14號(hào)染色體;人TCRβ和γ鏈基因分別位于第7對(duì)染色體的長(zhǎng)臂和短臂,小鼠β和γ鏈基因則分別位于第6和13號(hào)染色體。
表3-6 TCR多肽鏈基因定位
TCR基因 | 染色體定位 | |
人 | 小鼠 | |
α 鏈 | 14q11.12 | 14 |
β 鏈 | 7q32 | 6 |
γ 鏈 | 7p15 | 13 |
δ 鏈 | 14q11.2 | 14 |
TCR基因的結(jié)構(gòu)和重排與Ig基因有許多相似之處。在胚系中,編碼TCR多肽鏈的DNA是由幾個(gè)分隔開(kāi)的DNA片段組成,在胸腺細(xì)胞中重排后,形成編碼一條完整多肽的基因。TCR多肽鏈可變區(qū)基因是由2~4個(gè)基因片段通過(guò)重排連接在一起。V基因片段編碼信號(hào)序列和可變區(qū)氨基端95~100個(gè)氨基酸殘基;J基因片段編碼可變區(qū)羧基端13~23個(gè)氨基酸殘基。TCRβ、δ鏈V區(qū)基因除V、J基因片段外,還有1~2個(gè)D基因片段,編碼V與J之間數(shù)個(gè)氨基酸殘基。TCR不同多肽鏈可變區(qū)基因的重排可有V-J、V-D-J或V-D-D-J等幾種方式。TCR多肽鏈C基因片段通常由3~4個(gè)外顯子所組成,位于J基因片段的下游。與IgC基因片段不同,TCrC基因片段是由數(shù)個(gè)外顯子編碼一個(gè)結(jié)構(gòu)域,如β鏈的連接肽(connectingpeptide)是由3個(gè)分隔的外顯子所編碼。
(一)TCRα鏈基因
TCRα鏈基因與TCRβ鏈和Ig基因結(jié)構(gòu)有很大差別。小鼠α鏈V基因約100個(gè),至少可分為12個(gè)家族。人Vα大約在100個(gè)左右,長(zhǎng)約數(shù)百個(gè)kb。TCRα基因沒(méi)有Dα基因片段。人和小鼠α鏈基因都含有J基因片段(Jα),小鼠約有60個(gè),相互間隔至少500bp。VαJα連接具有多樣性。TCRα鏈基因只有1個(gè)Cα基因片段,含有4個(gè)外顯子。在TCRα鏈基因座中有TCRδ鏈基因。TCRα鏈基因重組信號(hào)中長(zhǎng)的間隔序列(23bp)3′端靠近Vα,短的間隔序列(12bp)的5′端靠近Jα,這種重組信號(hào)的排列方式類(lèi)似Ig輕鏈V區(qū)的基因,允許Vα基因直接與Jα基因重排,而不需要VD基因片段。
(二)TCRβ鏈基因
小鼠胚系中未重排的β鏈基因結(jié)構(gòu)已經(jīng)搞清,長(zhǎng)約數(shù)百kb。Vβ基因數(shù)目約30個(gè),大多數(shù)Vβ基因片段位于Cβ1的上游,至少有1個(gè)Vβ(Vβ14)在Cβ2基因3′下游10kb處,與轉(zhuǎn)錄的方向相反。人Vβ基因片段約有100個(gè)。小鼠和人都有2個(gè)Dβ基因片段,12~14bp長(zhǎng),分別位于Jβ1和Jβ2基因片段組上游約500~600bp處。小鼠和人都有2組(cluster)Jβ基因片段,稱(chēng)為Jβ1和Jβ2,與相應(yīng)的Cβ1和Cβ2基因片段間隔2~3kb。小鼠Jβ1和Jβ2各含7個(gè)Jβ基因片段,其中6個(gè)有功能,Jβ基因片段相互間隔36~421bp。人Jβ1和Jβ2各含7個(gè)有功能的Jβ基因片段。人和鼠TCRβ基因都有2個(gè)基本相同的Cβ基因片段,各含4個(gè)外顯子。Cβ1和Cβ2高度同源,2個(gè)Cβ基因片段的編碼產(chǎn)物中只有4個(gè)氨基酸殘基(小鼠)或5個(gè)氨基酸(人)不同。
TCRα和β鏈V基因編碼區(qū)域包括了相當(dāng)于Ig的CDR1和CDR2,主要是識(shí)別MHC分子和抗原的復(fù)合物。CDR3主要是由于V-D-J或V-D-D-J連接的多樣性(junctionaldiversity)和廣泛分布的N核苷酸插入(Nnucleotide insertion)所造成,其有高度的多樣性,可識(shí)別眾多種類(lèi)的抗原。
圖3-15 小鼠TCR基因的結(jié)構(gòu)
(三)TCRγ鏈基因
Vγ基因片段數(shù)較少,在Balb/c小鼠Vγ基因片段有7個(gè),分為5個(gè)家族,其中4個(gè)家族各只含1個(gè)Vγ,另一家族有3個(gè)Vγ。人Vγ有14個(gè),其中8個(gè)是有功能的。人和小鼠TCRγ鏈基因均不含D基因片段。在小鼠,有4個(gè)Jγ基因片段,基中Jγ1、Jγ3和Jγ4分別位于3個(gè)Cγ基因片段的上游,Jγ3為假基因。在人類(lèi)共有5個(gè)Jγ基因片段,可分為Jγ1和Jγ2兩組,其中Jγ1的3個(gè)片段位于Cγ1上游,Jγ2的2個(gè)片段位于Cγ2基因片段的上游。不鼠有4個(gè)Cγ基因片段,其中Cγ3是假基因。人有2個(gè)Cγ基因片段,相距約10kb,其中1個(gè)Cγ有3個(gè)外顯子,另一個(gè)Cγ含有4個(gè)或5個(gè)外顯子。編碼γ鏈連接肽部分的兩個(gè)Cγ基因外顯子組成存在著差異,有一個(gè)Cγ基因片段不編碼半胱氨酸,因此造成了TCRγ鏈在分子量、N-連接糖基化的形式以及是否與TCRδ鏈之間形成二硫鍵有所不同。
圖3-16 人TCR基因的結(jié)構(gòu)
(四)TCRδ鏈基因
人和小鼠TCr δ鏈基因結(jié)構(gòu)十分相似,均位于α鏈基因座內(nèi)。在Balb/c小鼠,Vδ基因片段數(shù)約為8個(gè)。在小鼠δ鏈基因中有2個(gè)Dδ、2個(gè)Jδ和1個(gè)Cδ基因。在胸腺細(xì)胞分化過(guò)程中,δ鏈先于α鏈表達(dá)。Vα與Jα重排可導(dǎo)致δ基因復(fù)合物中D、J和C基因片段的缺失。在人δ鏈基因中有8個(gè)Vδ基因片段,2個(gè)Dδ、3個(gè)Jδ和1個(gè)Cδ。某些Vδ基因片段是與TCRα鏈Vα基因共用的。
TCRδ鏈基因連接信號(hào)的排列方式是:每個(gè)Vδ基因片段的3′端緊靠著“七聚體-長(zhǎng)間隔序列-九聚體”(7-23-9)結(jié)構(gòu);Dδ基因片段5′端是“九聚體-短間隔序列-七聚體(9-12-7)結(jié)構(gòu),3′端是“7-23-9”結(jié)構(gòu);2個(gè)Jδ基因片段的5′端是“9-12-7”結(jié)構(gòu)。這種TCRδ鏈基因重組信號(hào)排列的方式使得V、D、J鏈接可有以下幾種不同方式:(1)V-D-J連接,在小鼠胚胎TCRγδ胸腺細(xì)胞最常見(jiàn)到Vδ-Dδ2-Jδ的連接,人胚胎胸腺細(xì)胞最常見(jiàn)到Vδ-Dδ3-Jδ;(2)V-J的直接連接;(3)大多數(shù)成年小鼠TCRγδ胸腺細(xì)胞以Vδ-Dδ1-Dδ2-Jδ連接,人妊娠后期胎兒TCRγδ胸腺細(xì)胞也存在著Vδ-Dδ1-Dδ2-Jδ的排列方式。Vδ基因位于Vα基因之中,同一個(gè)V基因片段可用作Vδ或Vα,如果V基因片段是用作Vδ,多發(fā)生V-D(-D)-J重排。
小鼠TCRγδ T細(xì)胞γ和δ鏈配對(duì)的,Vδ1幾乎總是和Vγ5或Vγ6配對(duì)。小鼠TCRγδ陽(yáng)性樹(shù)突狀表皮細(xì)胞(DEC)幾乎都是Vγ5與Vδ1配對(duì)。在人Vδ2幾乎總是與Vγ9配對(duì)。
圖3-17 小鼠TCRβ基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成
T細(xì)胞在胸腺中發(fā)育成熟過(guò)程中,TCgydjdsj.org.cn/jianyan/R基因按照一定的順序發(fā)生重排。TCR基因的重排順序和表達(dá)與免疫球蛋白基因的重排和表達(dá)十分相似。在基因組中的識(shí)別序列包括了一個(gè)保守的七聚體和九聚體,七聚體與九聚體之間含有一個(gè)不保守的12堿基對(duì)或23堿基對(duì)間隔序列(spacer sequence)。
TCRβ鏈基因座的重排要先于α鏈。首先是一個(gè)Dβ片段與一個(gè)Jβ片段連接,然后D-J與一個(gè)Vβ片段相連,完成了VDJ基因的重組。TCRβ鏈初級(jí)的RNA轉(zhuǎn)錄本在重組的VDJ和C基因之間含有內(nèi)含子。VDJ與Cβ1或Cβ2的重排是隨機(jī)的,目前尚未發(fā)現(xiàn)Cβ類(lèi)似Ig重鏈類(lèi)別轉(zhuǎn)換那樣從一個(gè)Cβ基因轉(zhuǎn)換到另一個(gè)Cβ基因上。在小鼠Cβ2基因的3′端推測(cè)有一個(gè)增強(qiáng)子。
TCRβ鏈基因的功能性重www.med126.com排和表達(dá),誘導(dǎo)了TCRα基因的重排。α鏈基因的重排與β鏈相似,由于α鏈基因不存在D片段,故α鏈基因只有V-J的連接。小鼠Vα轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的5′端有一個(gè)啟動(dòng)子,Cα基因的3′端也有一個(gè)增強(qiáng)子。此外,靠近α鏈增強(qiáng)子處有“靜息順序”(silencersequences),這些順序可抑制非T細(xì)胞或者是TCRγδT細(xì)胞中α鏈的轉(zhuǎn)錄。由于α鏈只有一個(gè)Cα基因,因此一旦初始的轉(zhuǎn)錄本形成后,經(jīng)過(guò)RNA加工只能產(chǎn)生一種完整的α鏈mRNA。
如同Ig基因的重排和表達(dá),TCRα和β鏈基因的重排和表達(dá)也有等位基因排斥現(xiàn)象(al-lelicexclusion),如果在一條染色體上TCR基因的重排是有效的,那末就可以抑制另一條染色體相應(yīng)等位基因座的重排。當(dāng)一條染色體上α鏈或β鏈基因座的重排、轉(zhuǎn)錄或翻譯無(wú)效時(shí),則另一條染色體上相應(yīng)α或β鏈相應(yīng)的等位基因座開(kāi)始發(fā)生重排。如果兩條染色體上TCRα或β鏈基因重排都無(wú)效,則未成熟的T細(xì)胞死亡。
推測(cè)T細(xì)胞庫(kù)(T cell repertoire)中多樣性在1010以上,其多樣性的原因與Ig相似,主要有以下幾方面。
1.胚系中有眾多的V、D和J基因片段 盡管TCRα和β基因中V基因片段數(shù)比Ig基因少,但J基因片段明顯比Ig基因?yàn)槎,如小鼠中約50~100個(gè)Jα和至少12個(gè)Jβ基因片段,而IgH和κ鏈基因座中J基因片段各只有4個(gè)。
2.連接處連接的多樣性 與IgVDJ連接的多樣性相似。
3.N區(qū)的插入 N區(qū)插入在Ig基因重排中只發(fā)生在重鏈基因,而TCRα和β鏈基因均可發(fā)生N區(qū)的插入。此外,在TCRα和β鏈基因中都發(fā)現(xiàn)一種稱(chēng)之為“易變性”(flexibility)的現(xiàn)象,如有一個(gè)以上Vα基因3′端可以連接到Jα片段。
4.TCRα與β鏈的隨機(jī)配對(duì) 人TCRαβ庫(kù)多樣性可推算為:α鏈(Vα(100)×Jα(100))×β鏈(Vβ(100)×Dβ(2)×Jβ(14))=2.8×107,這種多樣性尚未包括N區(qū)插入所擴(kuò)展的多樣性。
(金伯泉)