復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院位于上海繁華的徐家匯東側(cè)，她有著悠久的歷史和優(yōu)良的學(xué)風(fēng)，享譽海內(nèi)外。隨著中國教育體制的改革，2000年4月原復(fù)旦大學(xué)（創(chuàng)建于1905年）與原上海醫(yī)科大學(xué)（創(chuàng)建于1927年）合并，復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院于2001年7月27日成立，由復(fù)旦大學(xué)副校長王衛(wèi)平教授兼任院長。
　　復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院成立以來大膽探索體制改革。為創(chuàng)辦綜合性大學(xué)的一流醫(yī)學(xué)院，促進(jìn)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和臨床醫(yī)學(xué)的結(jié)合，加快醫(yī)學(xué)學(xué)科建設(shè)，由醫(yī)學(xué)院的領(lǐng)導(dǎo)和各附屬醫(yī)院的院長組成上海醫(yī)學(xué)院院務(wù)委員會，是學(xué)院的咨詢決策機構(gòu)。在教學(xué)管理架構(gòu)上設(shè)有27個系。在行政管理架構(gòu)上設(shè)有黨委辦公室、院長辦公室、教學(xué)辦公室、科研辦公室和本科生、研究生工作組，負(fù)責(zé)管理和協(xié)調(diào)學(xué)院各方面的工作。學(xué)院現(xiàn)有國家重點學(xué)科20個；國家重點實驗室1個；“211工程”建設(shè)重點學(xué)科8個；教育部、衛(wèi)生部重點實驗室9個；上海市重點學(xué)科2個；上海市臨床醫(yī)學(xué)中心8個。有博士后流動站4個，博士點29個，碩士點36個。