生物體對環(huán)境的反應(yīng)、防衛(wèi)和適應(yīng)性的研究，既是現(xiàn)代生理學(xué)與生態(tài)學(xué)的前沿又是社會經(jīng)濟(jì)可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略的生物學(xué)基礎(chǔ)之一。將結(jié)合現(xiàn)有的科研基礎(chǔ)及社會需求，著重開展與農(nóng)業(yè)的現(xiàn)代化及可持續(xù)發(fā)展有密切關(guān)系的、包括城市設(shè)施農(nóng)業(yè)的關(guān)鍵理論與技術(shù)在內(nèi)的一系列研究。
戰(zhàn)略性高技術(shù)創(chuàng)新研究著重于結(jié)合重大社會經(jīng)濟(jì)目標(biāo)，以建立具有競爭性的平臺技術(shù)（如：基因工程、細(xì)胞工程、組織工程與代謝工程等技術(shù))為目標(biāo)進(jìn)行創(chuàng)新。內(nèi)容主要有：轉(zhuǎn)基因技術(shù)，轉(zhuǎn)基因動植物反應(yīng)器，異種器官移植，基因診斷和治療技術(shù)，基因資源的保護(hù)、開發(fā)和利用及環(huán)境生物技術(shù)。
生物學(xué)與物理、數(shù)學(xué)等學(xué)科之間的交叉。特別是以DNA芯片為主的納米生物技術(shù)和生物信息學(xué)（遺傳語言)的研究。
目前，上海的生命科學(xué)研究所承擔(dān)了如國家攀登計(jì)劃、國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展規(guī)劃、國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃、國家載人航天計(jì)劃和國家自然科學(xué)基金等十余項(xiàng)國家重大研究項(xiàng)目和一批院、上海市的重大研究項(xiàng)目，在國內(nèi)有很強(qiáng)的競爭力。除圓滿完成這些項(xiàng)目的研究任務(wù)外，上海生命科學(xué)研究院將有步驟地繼續(xù)組織各研究所的科研力量，圍繞前述重點(diǎn)研究領(lǐng)域，形成一些重大科研項(xiàng)目。研究院將支持這些項(xiàng)目的研究，并爭取這些項(xiàng)目在國家、院或上海市立項(xiàng)，以爭取國家、地方和院的支持。在一些基礎(chǔ)研究的綜合性大項(xiàng)目方面，將聯(lián)合全國范圍的研究力量，大力開展國際合作。
研究院的重要任務(wù)之一是保護(hù)知識產(chǎn)權(quán)、推動科技成果轉(zhuǎn)化和促進(jìn)高科技產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。為此，研究院擬建立生物技術(shù)知識產(chǎn)權(quán)的經(jīng)營管理中心，生物醫(yī)藥高科技風(fēng)險(xiǎn)投資咨詢管理公司和生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)化的孵化基地。
上海生命科學(xué)研究院將從各研究所的科研技術(shù)和管理人員中優(yōu)選（或招聘)650人給予重點(diǎn)支持，增加他們的科研經(jīng)費(fèi)和提高他們的生活待遇。其中包括將從院外（主要是海外)招聘40位優(yōu)秀青年學(xué)術(shù)帶頭人擔(dān)任研究組長。研究生、博士后和客座研究人員等流動研究人員將增加到1000人以上。根據(jù)存量資源不變，增量資源試點(diǎn)的原則，研究院也將鼓勵未得到重點(diǎn)支持的研究人員積極爭取和完成國家或地方任務(wù)，并努力妥善安排其他人員。
研究院成立后，將進(jìn)一步推進(jìn)研究所的改革。研究所將進(jìn)一步明確科研方向，緊縮管理機(jī)構(gòu)，精干科研隊(duì)伍。研究所的管理職能將由目前的綜合性管理體制逐步轉(zhuǎn)向以科研學(xué)術(shù)管理為重點(diǎn)的體制。研究所的其他管理職能將轉(zhuǎn)移到研究院，實(shí)行研究院一級法人的體制。
研究院將建立和健全科學(xué)管理體制。聘請國內(nèi)外著名科學(xué)家參加研究院研究組長招聘工作和研究院學(xué)術(shù)委員會。重大研究項(xiàng)目實(shí)行首席科學(xué)家負(fù)責(zé)制，嚴(yán)格實(shí)行目標(biāo)管理。采取有效措施，建設(shè)全心全意為科研服務(wù)的高效率的管理隊(duì)伍，培養(yǎng)精通業(yè)務(wù)的技術(shù)支撐力量。
研究院和研究所都要強(qiáng)化競爭機(jī)制。在人員的聘用上執(zhí)行公開招聘、擇優(yōu)錄取、嚴(yán)格考評、開放流動的方針，努力創(chuàng)造條件，發(fā)揮科研人員自由探索科學(xué)奧秘的主動性和積極性。對得到重點(diǎn)支持的研究組進(jìn)行定期的嚴(yán)格考核，實(shí)行績效掛鉤。全面實(shí)行合同聘任制。極少數(shù)特別優(yōu)秀的研究組長可以授予永久性職位。
上海生命科學(xué)研究院建立后，將根據(jù)輕重緩急逐步進(jìn)行岳陽路園區(qū)的改造，為科學(xué)研究提供良好的環(huán)境，把岳陽路地區(qū)建設(shè)成為面向21世紀(jì)的生命科學(xué)園區(qū)。
上海生命科學(xué)研究院將積極推動院、市合作，共建研究基地，如與上海第二醫(yī)科大學(xué)全面合作共建健康科學(xué)研究中心，積極與上海高校和科研單位聯(lián)合，繼續(xù)與
上海交通大學(xué)和上海大學(xué)等已開展的合作,進(jìn)入浦東和漕河涇科技開發(fā)區(qū)，服務(wù)當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)，為上海地區(qū)的社會發(fā)展和經(jīng)濟(jì)建設(shè)作出應(yīng)有的貢獻(xiàn)。
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