福建醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院成立于2001年1月，前身是基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部，始建于1959年。
學(xué)院擁有一支結(jié)構(gòu)合理、素質(zhì)優(yōu)良的師資隊伍�，F(xiàn)有教職工269人，專任教師187人，其中教授18人，副教授50人，博士生導(dǎo)師2人，碩士生導(dǎo)師26人。專業(yè)基礎(chǔ)教師隊伍中，有博士學(xué)位19人，在職攻讀博士學(xué)位17人，有碩士學(xué)位67人，碩士學(xué)位以上占教師數(shù)61.3%。享受國務(wù)院政府特殊津貼的專家7人，福建省教委優(yōu)秀中青年骨干教師2人，入選“百千萬人才工程”人選10人，校學(xué)科帶頭人培養(yǎng)對象13人，校青年骨干教師38人。
學(xué)院積極進(jìn)行教學(xué)改革，以學(xué)院成立為契機，對基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)二級學(xué)科進(jìn)行調(diào)整和建設(shè)，由原來以教研室為管理單位改成以系（部)為管理單位。現(xiàn)學(xué)院設(shè)有人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)、生理學(xué)與病理生理學(xué)、病理學(xué)、病原生物學(xué)、免疫學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)與遺傳學(xué)等7個學(xué)系以及數(shù)理與計算機學(xué)、外語等2個教學(xué)部。建有機能學(xué)科綜合實驗室、形態(tài)學(xué)科綜合實驗室、生物化學(xué)與分子生物學(xué)實驗室、病原生物學(xué)綜合實驗室、人體解剖學(xué)綜合實驗室、數(shù)理與計算機教學(xué)綜合實驗室等6個教學(xué)實驗室，進(jìn)一步推動了實驗教學(xué)內(nèi)容和教學(xué)手段的改革。
學(xué)院堅持以學(xué)科建設(shè)為重點，狠抓科研基地和學(xué)位點建設(shè)，先后建立了分子醫(yī)學(xué)、細(xì)胞與發(fā)育工程、神經(jīng)生物學(xué)3個研究中心，推動了學(xué)院的科研工作，學(xué)位點數(shù)也逐年增加。目前，學(xué)院在腫瘤分子生物學(xué)、感染與免疫分子生物學(xué)、神經(jīng)分子生物學(xué)等方面的研究形成了自己的特色和優(yōu)勢。擁有博士學(xué)位授權(quán)點1個（病原生物學(xué))，碩士學(xué)位授權(quán)點8個，培養(yǎng)范圍涵蓋了基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和生物學(xué)2個一級學(xué)科。學(xué)院還擁有省級“211”重點學(xué)科--分子醫(yī)學(xué)；4個校級重點學(xué)科--病原生物學(xué)、病理學(xué)、人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)；1門省級精品課程--病理學(xué)；2個省級重點實驗室--機能學(xué)科綜合實驗室和形態(tài)學(xué)科綜合實驗室；以及生殖醫(yī)學(xué)研究室、腫瘤研究室、基因工程研究室等省內(nèi)著名的科研機構(gòu)。1997年以來，學(xué)院承擔(dān)國家級、省級、廳級科研項目120多項，其中國家級和省級重大科研項目18項；有18項科研成果獎，其中省科技進(jìn)步二、三等獎13項。
學(xué)院將緊緊抓住我省大學(xué)城建設(shè)帶來的高教事業(yè)發(fā)展的極好機遇，一如既往地遵循"勤奮、嚴(yán)謹(jǐn)、求實、創(chuàng)新"的校訓(xùn)，圍繞學(xué)校"十五"規(guī)劃，瞄準(zhǔn)2010年遠(yuǎn)景目標(biāo)，以嶄新的精神面貌，迎接新的挑戰(zhàn)；以培養(yǎng)具有創(chuàng)新精神和實踐能力的高素質(zhì)醫(yī)學(xué)人才為根本任務(wù)，深化教育教學(xué)改革，全面推進(jìn)素質(zhì)教育；以教學(xué)為中心，本科教育為主體，教學(xué)質(zhì)量為生命線，加強學(xué)科建設(shè)和師資隊伍建設(shè)，發(fā)揮基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院的特點和優(yōu)勢，為實現(xiàn)2010年我校進(jìn)入國內(nèi)省屬同類高校先進(jìn)行列的目標(biāo)而努力奮斗！
學(xué)科建設(shè)
博士學(xué)位授權(quán)點：病原生物學(xué)
碩士學(xué)位授權(quán)點：病理學(xué)與病理生理學(xué)、病原生物學(xué)、人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)、生物化學(xué)、免疫學(xué)、
分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、生理學(xué)
省級"211"重點學(xué)科：分子醫(yī)學(xué)
校級重點學(xué)科：病原生物學(xué)、病理學(xué)、人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)
省級優(yōu)秀課程：病理解剖學(xué)、生物化學(xué)、組織胚胎學(xué)、生理學(xué)、人體解剖學(xué)
省級精品課程：病理學(xué)
綜合實驗室：機能學(xué)科綜合實驗室、形態(tài)學(xué)科綜合實驗室、生物化學(xué)與分子生物學(xué)實驗室、
病原生物學(xué)綜合實驗室、人體解剖學(xué)綜合實驗室和數(shù)理與計算機教學(xué)綜合實驗室
省級重點實驗室：機能學(xué)科綜合實驗室、形態(tài)學(xué)科綜合實驗室
三個研究中心：分子醫(yī)學(xué)研究中心、細(xì)胞與發(fā)育工程研究中心、神經(jīng)生物學(xué)研究中心
