人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片和制作方法及檢測方法

醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫中心藥學(xué)論壇

公開(公告)號

CN1687451A

公開(公告)日

2005.10.26

申請(專利)號

CN200510013318.4

申請日期

2005.04.13

專利名稱

人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片和制作方法及檢測方法

主分類號

C12Q1/68

分類號

C12Q1/68

分案原申請?zhí)?

優(yōu)先權(quán)

申請(專利權(quán))人

天津市紫波高科技有限公司

發(fā)明(設(shè)計(jì))人

高英堂;方淑昌;杜智

地址

300170天津市河?xùn)|區(qū)津塘路83號

頒證日

國際申請

進(jìn)入國家日期

專利代理機(jī)構(gòu)

天津市三利專利商標(biāo)代理有限公司

代理人

王義為

國省代碼

天津;12

主權(quán)項(xiàng)

一種人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片，其特征是芯片基質(zhì)上設(shè)置探針，包括識別所有HPV基因型的通用探針1個(gè)，HPV基因型特異探針15個(gè)，用于區(qū)分HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV42、HPV43、HPV44、HPV45、HPV52、HPV56、HPV58共計(jì)15種基因型，探針在芯片上微陣列排列，至少5個(gè)以上坐標(biāo)點(diǎn)控制芯片的矩形點(diǎn)樣區(qū)域，以坐標(biāo)點(diǎn)控制芯片的矩形點(diǎn)樣區(qū)域和點(diǎn)樣方向，微陣列中一個(gè)角設(shè)置2個(gè)坐標(biāo)點(diǎn)，為點(diǎn)樣起始點(diǎn)，指示探針排列方向，微陣列的其他3個(gè)角上為1個(gè)坐標(biāo)點(diǎn)，微陣列的縱列至少3列以上，微陣列的橫行至少3行以上；每個(gè)HPV探針點(diǎn)樣1個(gè)以上，通用探針是所有HPV的共有序列，HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35、HPV42、HPV43、HPV44、HPV45、HPV52、HPV56、HPV58代表15種基因型，“+”代表陽性質(zhì)控點(diǎn)，排列方式由通用探針到各型探針由小數(shù)到大數(shù)依次排列，再加上陰性和陽性質(zhì)控點(diǎn)，點(diǎn)陣數(shù)至少18點(diǎn)以上；PCR引物采用2對24條鏈的套式引物組合，其核苷酸序列如下表所示，

基因型

序列組成

上游外引物

6/11

5’GC(C/T)CAGGGACATAACAATGG3′

18/58

5’GCACA(G/A)GGTCATAACAATGG3′

39/45

5’GCCCAGGGCCA(T/C)AACAATGG3′

33/35/56

5’GCACAAGG(T/C)CATAATAATGG3′

31/42

5’GCTCA(G/A)GGACACAATAATGG3′

44/52/16

5’GC(G/A)CAGGGCCACAATAATGG3′

上游內(nèi)引物

6/11/18/31/33

5’TTTGTTACTGTGGTAGATAC3′

44/56

5’TTTGTTACTGT(T/A)GTAGATAC3′

35/58/42

5’TTTGTTAC(T/C)GT(A/G)GTTGATAC3′

5’TTTGTCACAGTTGTGGATAC3′

39/45

5’TTTGTTACTGT(A/T)GTGGACAC3′

5’TTTGTTACTGTTGTTGATAC3′

下游外引物

6/33/58

5’CGTCCCAAAGGA(T/A)ACTGATC3′

5’CGGCCCAACGGAAACTGATC3′

摘要

本發(fā)明是人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片和制作方法及檢測方法。在芯片基質(zhì)上設(shè)置16種探針，探針在芯片上微陣列排列，包括通用探針1個(gè)，HPV型特異探針有15個(gè)，用于區(qū)分HPV基因型6、11、16、18、31、33、35、39、42、43、44、45、52、56、58等共計(jì)15種基因型，在特異探針末端加一段特定的聚核苷酸尾巴，將點(diǎn)好的芯片放在紫外交聯(lián)儀內(nèi)進(jìn)行照射5分鐘，使探針完全固定在芯片上，構(gòu)成檢測診斷芯片。PCR引物采用2對24條鏈的套式引物組合。本發(fā)明具有診斷準(zhǔn)確、快速、診斷方法簡單、特異性強(qiáng)、信息量高和易于推廣使用的特點(diǎn)，臨床應(yīng)用具有極大的經(jīng)濟(jì)效益和社會(huì)效益。

國際公布

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