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對(duì)痢疾志賀氏菌3型、大腸桿菌O124與O164的O-抗原特異的核苷酸

公開(公告)號(hào) CN1285726C  
公開(公告)日 2006.11.22  
申請(qǐng)(專利)號(hào) CN03109587.9  
申請(qǐng)日期 2003.04.15  
專利名稱 對(duì)痢疾志賀氏菌3型、大腸桿菌O124與O164的O-抗原特異的核苷酸  
主分類號(hào) C12N15/31(2006.01)I  
分類號(hào) C12N15/31(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C07H21/00(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I;G01N33/569(2006.01)I  
分案原申請(qǐng)?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(qǐng)(專利權(quán))人 南開大學(xué)  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 王 磊;楊靜華;馮 露  
地址 300071天津市南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院  
頒證日  
國(guó)際申請(qǐng)  
進(jìn)入國(guó)家日期  
專利代理機(jī)構(gòu) 天津三元專利商標(biāo)代理有限責(zé)任公司  
代理人 胡婉明  
國(guó)省代碼 天津;12  
主權(quán)項(xiàng) 一種對(duì)痢疾志賀氏菌3型、大腸桿菌O124和大腸桿菌O164的O-抗原特異的寡核苷酸,其特征在于,所述寡核苷酸對(duì)是:SEQ ID NO:1中的1221至1240堿基的核苷酸和2148至2167堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的1220至1238堿基的核苷酸和1884至1903堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的1835至1853堿基的核苷酸和2325至2345堿基的核苷酸;SEQ ID NO:1中的5391至5409堿基的核苷酸和5824至5843堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的5377至5396堿基的核苷酸和6107至6125堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的5575至5594堿基的核苷酸和6114至6132堿基的核苷酸;SEQ ID NO:1中的6182至6200堿基的核苷酸和6874至6895堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的6168至6186堿基的核苷酸和6824至6842堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的6172至6190堿基的核苷酸和6584至6602堿基的核苷酸;SEQ ID NO:1中的7969至7990堿基的核苷酸和7256至7276堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的7257至7277堿基的核苷酸和7768至7786堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的7410至7430堿基的核苷酸和7955至7973堿基的核苷酸;SEQ ID NO:1中的8410至8428堿基的核苷酸和9109至9127堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的8405至8423堿基的核苷酸和9242至9260堿基的核苷酸,SEQ ID NO:1中的8449至8467堿基的核苷酸和9040至9059堿基的核苷酸或SEQ ID NO:1中的10450至10468堿基的核苷酸和11123至11141堿基的核苷酸,SEQ IDNO:1中的10451至10469堿基的核苷酸和10803至10821堿基的核苷酸,SEQID NO:1中的10565至10583堿基的核苷酸和11124至11142堿基的核苷酸。  
摘要 本發(fā)明提供一種對(duì)痢疾志賀氏菌3型(Shigella dysenteriae 3)、大腸桿菌O124(Escherichia coli O124)和大腸桿菌O164(Escherichia coli O164)的O-抗原特異的核苷酸,它是痢疾志賀氏菌3型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分離的核苷酸,全長(zhǎng)12629個(gè)堿基;或者具有一個(gè)或多個(gè)插入、缺失或取代的堿基,同時(shí)保持所述分離的核苷酸功能的SEQ ID NO:1的核苷酸;還包括源于痢疾志賀氏菌3型的O-抗原基因簇中的糖基轉(zhuǎn)移酶基因和寡糖單位處理基因的寡核苷酸。本發(fā)明通過PCR證實(shí)寡核苷酸對(duì)痢疾志賀氏菌3型、大腸桿菌O124和大腸桿菌O164的O-抗原都有高度的特異性。本發(fā)明還公開了用本發(fā)明的寡核苷酸檢測(cè)和鑒定人體及環(huán)境中的痢疾志賀氏菌3型、大腸桿菌O124和大腸桿菌O164的方法。  
國(guó)際公布  
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