另外,還有不少學者研究了半導體納米材料對PCR體系的抑制作用。早期有學者將微米級的硅顆粒以及表面經(jīng)過處理的硅加入到PCR體系中[38,39],發(fā)現(xiàn)微米級的硅對PCR過程有較明顯的抑制作用。王瑋等[40]將納米級的硅引入PCR體系中,探討了表面氧化程度不同的硅納米顆粒對PCR擴增的抑制作用及其機理。實驗結果表明,隨著硅材料表面積與PCR反應體系體積比的增大,核酸擴增效率明顯下降;并且在所研究的范圍內,表面氧化程度越高的硅納米顆粒對PCR的抑制作用越強。對抑制作用機理的初步研究表明, 硅納米顆粒對PCR反應液中Taq酶的吸附是導致抑制現(xiàn)象產(chǎn)生的主要原因。而對模板的吸附對PCR的影響較小,而且,硅納米顆粒本身對PCR沒有明顯的直接化學抑制作用。
李世強等[41]考察了在避光條件下,銳鈦礦型納米TiO2對PCR體系的影響,結果表明,納米TiO2對PCR體系有抑制作用。隨著納米TiO2量的增加,對DNA合成的抑制也越強,且抑制作用強于微米級的TiO2。將預先分別與納米TiO2作用的聚合酶、引物和模板加入到PCR體系中,聚合酶的上層清液、引物的沉淀、模板的上層清液與沉淀均有 DNA的合成,但合成量均小于納米TiO2直接加入PCR的DNA的合成量。他們認為在避光下,銳鈦礦型納米TiO2抑制DNA合成的主要原因是納米TiO2具有高的比表面積,對聚合酶、引物和模板存在較強的吸附作用, 對引物的吸附作用最強,對聚合酶的吸附最弱。
3 總結與展望
將納米材料引入到聚合酶鏈反應中,可以同時發(fā)揮納米材料和DNA的優(yōu)點,極大地拓寬PCR技術的應用范圍。將納米材料用于PCR體系中,提高了PCR的特異性,增加了產(chǎn)量;拓寬了PCR的退火溫度范圍,使PCR在低至25 ℃時也能退火;有利于小片段DNA的擴增;可以代替緩沖液中Mg2+的作用。
預計今后的相關研究將會側重于以下幾個方面:(1) 尋找有利于大片段DNA擴增的納米材料。目前研究發(fā)現(xiàn)納米金對PCR的促進作用是更有利于小片段DNA(1 kb以下)的擴增。而在實際應用中,大片段DNA的擴增非常重要,F(xiàn)在基因克隆研究中,長片段以及超長片段DNA(10 kb以上)的擴增還不能取得滿意的效果,主要原因是酶在PCR較高的變性溫度下(94 ℃)長時間的工作,會出現(xiàn)活性降低甚至失活,因此研究納米材料對PCR變性溫度的影響具有重要意義。通過納米材料來降低PCR的變性溫度或者增強聚合酶的耐高溫性質來實現(xiàn)長片段擴增的理想效果,是今后的一個研究方向;(2) 尋找新的納米材料來實現(xiàn)聚合酶的可控定量供應。細胞內有一整套參與反應的分子數(shù)量的定量控制體系,尤其是各種生物酶。而在PCR中,模板呈指數(shù)增長,對各反應組分尤其是聚合酶的需求也在變化,聚合酶不足會降低DNA的合成量,過量又易引發(fā)非特異擴增。通過納米材料來調控PCR過程中聚合酶的量,將有望解決現(xiàn)在PCR技術中存在的若干問題;(3) 使用人工納米材料將聚合酶和PCR的其它各反應成分連接起來,使其充分接觸反應,從而提高PCR反應效率;(4)根據(jù)PCR體系各種抑制劑的作用機制的不同,引入表面修飾有各種官能團的人工納米材料,與各種抑制劑反應,消除其對PCR體系的負面影響醫(yī).學.全.在.線gydjdsj.org.cn。
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