南京大學的前身中央大學和金陵大學，都是中國最早進行研究生教育的大學。新中國成立以后，南京大學于1954年恢復研究生招生，直至1965年，全校共招收276名研究生。1978年，南京大學又一次成為全國首批恢復招收研究生的高校之一；1984年，南京大學和21所兄弟院校被列為首批試辦研究生院的單位。南京大學研究生院的建立，標志著南京大學的發(fā)展進入了一個新的階段。在1995年初由國務院學位委員會辦公室和國家教育委員會對全國33所研究生院綜合評估中，南京大學名列第三，被批準正式成立南京大學研究生院。隨著南京大學首批進入“211工程”建設以及國家重點建設的高水平大學的行列，南京大學研究生教育進入了一個嶄新的發(fā)展時期。到2005年6月底，已授博士學位2890名、碩士學位14362名。目前在校研究生9324名，其中博士生2976名，碩士生6348名。2003年12月由教育部批準設立的南京大學蘇州研究生院目前正式啟動。

南京大學研究生院建院初，就明確以學科建設為龍頭，而后學科建設辦公室主任由研究生院院長兼任，統(tǒng)籌研究生教育和學科建設工作。目前全校共有18個博士后流動站、16個博士學位授權的一級學科、116個博士學位專業(yè)、180個碩士學位專業(yè)、7個專業(yè)學位授權點。經(jīng)多年建設，學校擁有了一批新興交叉學科方向、28個國家重點學科、10個江蘇省重點學科、10個國家級重點實驗室、11個國家基礎學科應用科研和人才培養(yǎng)基地、3個教育部人文社會科學重點研究基地、69個跨學科研究中心。他們?yōu)槟暇┐髮W研究生教育提供了堅實基礎。

南京大學擁有一批國內外具有重要學術影響的資深學者，集中了一批優(yōu)秀的中青年學術骨干活躍在指導研究生的第一線，其中中國科學院和工程院院士26名、“國家重點基礎研究發(fā)展規(guī)劃”項目首席科學家2名、國家級有突出貢獻的中青年專家18名、教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授36名、國家杰出青年基金獲得者 70名、教育部“跨世紀優(yōu)秀人才培養(yǎng)計劃”人選35名、國家級教學名師4名，在崗博士生導師630名。他們以嚴謹?shù)闹螌W態(tài)度、活躍的學術思想把南京大學的研究生引向科學研究的前沿。

南京大學研究生教育圍繞南京大學創(chuàng)建世界一流大學的總體目標、開辟南京大學研究生培養(yǎng)和合作科研的廣闊渠道。一批著名政治家、社會活動家如前聯(lián)合國秘書長布托·加利、前美國總統(tǒng)布什、前德國總統(tǒng)約翰內斯·勞、前澳大利亞總理霍克等以及著名科學家吳健雄、袁家騮、許靖華、史蒂文·穆勒等被授予南京大學名譽博士學位；創(chuàng)建了中美文化研究中心、中德經(jīng)濟法研究所、中日文化研究中心等機構共同培養(yǎng)研究生；1994年，南京大學研究生教育走出國門，經(jīng)教育部批準赴新加坡開辦MBA班，先后又在新加坡、馬來西亞開辦中文碩士、MBA班，與荷蘭合辦MBA班。

近年來，南京大學在研究生招生、培養(yǎng)、學位授予、非學歷教育、思想教育管理諸方面取得了可喜成績。南京大學被SCI收錄的論文50%以上是在校研究生為第一作者；在《中華人民共和國學位條例》頒布十周年之際，南京大學自己培養(yǎng)的20名畢業(yè)生被國務院、教育部授予“在工作中做出突出貢獻的中國博士、碩士學位獲得者”的光榮稱號； 22位博士獲得“全國優(yōu)秀博士學位論文”獎；25部教材由教育部及國務院學位委員會辦公室推薦為“全國研究生教學用書”。

隨著南京大學“211工程”全面實施和“985工程”二期的啟動，南京大學研究生教育將努力探索高素質高層次人才培養(yǎng)的新思路、新模式，把南京大學研究生教育的各項工作扎扎實實落到實處，為南京大學創(chuàng)建世界一流大學的目標勤奮工作。