中醫(yī)臨床基礎碩士學位點是2003年新增碩士點。本學科師資力量雄厚，擁有一批國內著名的中醫(yī)學家，現有教授6人，副教授11人，講師3人，其中碩士8人，在讀博士生3人。幾十年來，學科組辛勤耕耘，代代相傳，取得了豐碩成果，確立中醫(yī)臨床基礎學科的核心是中醫(yī)辨證論治理論體系及其具體運用，“立足臨床，繼承創(chuàng)新”為培養(yǎng)碩士生的指導思想。

主要研究方向：①仲景病證結合診治規(guī)律及其臨床運用研究。其特色在于借助臨床及文獻、實驗等手段和方法，全面系統(tǒng)整理和客觀標準地揭示仲景確立的病證結合診治體系涉及的多層次內容所涵蓋的基本規(guī)律。②《傷寒論》、《金匱要略》治則治法及方藥配伍規(guī)律的研究；③《傷寒論》、《金匱要略》溫病學原著的文獻學及學術思想研究；④經方治療疑難病癥機理研究；⑤外感病辨證體系及診治規(guī)律的研究。

本學科在安徽省和國內都具有顯著的特色和優(yōu)勢，近五年內，共發(fā)表論文264篇，獲省部級獎4項，出版《傷寒論通俗講義》、《金匱要略講義》、《溫病學講義》、《內經通俗講義》、《中醫(yī)外感病學》及《金匱要略臨床新解》等專著70余部。目前承擔各科研項目共21項，科研經費達30萬。