1907年5月，德籍醫(yī)師埃里希·寶隆博士等人創(chuàng)建上海德文醫(yī)學(xué)堂。埃里希·寶隆任校長。校址設(shè)在上海白克路（今鳳陽路）。
1908年改名為同濟德文醫(yī)學(xué)堂。
1912年增設(shè)工科。

1917年4月，改屬華人私立學(xué)校，由華人董事會辦學(xué)。同年12月，更名為私立同濟醫(yī)工專門學(xué)校。1922年由市區(qū)遷往近郊吳松鎮(zhèn)。

1924年5月20日，經(jīng)南京國民政府教育部批準(zhǔn)，改名為同濟醫(yī)工大學(xué)。

1927年8月，由南京國民政府教育部接管，命名為國立同濟大學(xué)，原醫(yī)、工兩科分別改名為醫(yī)學(xué)院、工學(xué)院。1937年又先后增設(shè)了文、理、法等學(xué)院，從而成為一所多科性的綜合大學(xué)。

1949年8月，同濟大學(xué)校務(wù)委員會成立，唐哲任校務(wù)委員會常務(wù)委員兼醫(yī)學(xué)院院長。1950年2月，中央人民政廳政務(wù)院決定，國立同濟大學(xué)醫(yī)學(xué)院及其附屬同濟醫(yī)院內(nèi)遷武漢，與武漢大學(xué)醫(yī)學(xué)院合并，命名為“中南同濟醫(yī)學(xué)院”，由中南軍政委員會衛(wèi)生部主管。同年10月，300多名師生積極報名參加醫(yī)療隊，為抗美援朝志愿軍服務(wù)。

1955年8月更名為武漢醫(yī)學(xué)院。
　
1985年學(xué)校更名為同濟醫(yī)科大學(xué)。
　
2000年6月25日，同濟醫(yī)科大學(xué)和華中理工大學(xué)、武漢城建學(xué)院合并，武漢科技職工大學(xué)（科技部管理學(xué)院）并入，組建華中科技大學(xué)。6月16日，成立華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院。