我校于1978年開始招收研究生，1981年成為碩士學位授予單位�，F擁有碩士學位授權點16個，在校全日制研究生295人，外籍研究生10余名，并開展了在職人員以研究生同等學力申請碩士學位、臨床醫(yī)學專業(yè)學位等多種途徑的研究生培養(yǎng)和學位授予工作。

做為1978年文革后首批研究生招生單位，我校研究生教育穩(wěn)步發(fā)展，治學嚴謹、實力雄厚的導師隊伍，特色突出、優(yōu)勢明顯的學科群體，為培養(yǎng)高質量的研究生營造了良好的氛圍。所培養(yǎng)的研究生在國內外中醫(yī)藥教育、科研、醫(yī)療、管理以及企業(yè)的崗位上發(fā)揮著重要作用，許多已經畢業(yè)的研究生成為相關學科領域的帶頭人和學術骨干。大批研究生畢業(yè)后，繼續(xù)在清華大學、中國科技大學、中國科學院、北京中醫(yī)藥大學、廣州中醫(yī)藥大學、上海中醫(yī)藥大學等國家重點院校深造，攻讀博士學位。2003年兩名外籍研究生，在我校針灸推拿學專業(yè)順利通過論文答辯，獲得碩士學位。這是我校乃至安徽省省屬高校首批授予外籍研究生碩士學位。其后，又有近20名外籍研究生相繼在我校攻讀碩士學位，顯示研究生教育在我校對外辦學方面發(fā)揮重要作用。為保證我校研究生的培養(yǎng)質量，學校著重在以下方面加強管理：

1、夯實理論功底, 提高教學質量。我校為各專業(yè)研究生開設了70余門課程，研究生導師、正高職稱以上教師上課率達70%以上。因此，我校畢業(yè)的研究生知識結構合理、基礎理論扎實，有很大的發(fā)展?jié)摿�。在歷屆畢業(yè)研究生中有近百人通過進一步深造，在國內外獲得了博士學位，部分研究生通過選拔，以訪問學者的身份出國進行學術交流。

2、注重實際工作能力，提高學位論文水平。各學科專業(yè)均注重對研究生臨床能力及科研能力的培養(yǎng)，研究生的畢業(yè)論文則要求結合導師的研究方向和科研課題來完成。在每年研究生接力棒式的培養(yǎng)過程中，各相關學科均形成了穩(wěn)定的研究方向，科研水平不斷提高。同時，在高水平的科研活動中，研究生的實際動手能力得到了培養(yǎng)和提高，畢業(yè)后能較快適應臨床、科研工作的需要，發(fā)揮骨干作用。學校還積極利用校外資源不斷拓寬研究生的培養(yǎng)渠道，分別與南京軍區(qū)總醫(yī)院、安徽省藥物研究所、山東文登整骨醫(yī)院、廣州軍區(qū)總醫(yī)院、武警安徽總醫(yī)院等單位簽訂了聯合培養(yǎng)協議，聘任了一批具有較高學術水平的兼職導師，為研究生的能力培養(yǎng)提供了有利條件。

我校各碩士學位點均擁有一支治學嚴謹、知識淵博的導師隊伍，科研工作取得了引人注目的成績。中醫(yī)呼吸內科為國家中醫(yī)藥管理局重點學科，中醫(yī)內科學、針灸推拿學、中西醫(yī)結合臨床為省級重點學科。中醫(yī)內科學學科的呼吸系統疾病研究、針灸推拿學學科的經絡研究等方向，參與并承擔著國家重點基礎發(fā)展計劃（“九七三”計劃）和自然科學基金資助項目。中西醫(yī)結合臨床學科的肝豆病研究，收集的病例數居世界首位，在這些具有明顯特色和優(yōu)勢的研究方向上進行論文選題，已然立足于國內或國際先進水平，并極具研究潛力。

3、重視思想教育，提高道德水準。學校對研究生思想政治工作高度重視。在招生錄取、業(yè)務培養(yǎng)、學籍管理、選優(yōu)評獎、學位授予等幾個環(huán)節(jié)上堅持德育標準，注重思想表現，體現正確導向，奮發(fā)向上的精神鼓勵廣大研究生勇攀科學高峰，以實事求是的態(tài)度塑造研究生的科研道德、醫(yī)療道德。社會主義市場經濟的熱潮，增強了研究生的競爭意識，成才意識，但不盲目追求個人價值，以強烈的社會責任感和使命感投身于祖國的建設大業(yè)中去，實現個人價值與社會價值的有機結合，在我校研究生中已形成主流。