復(fù)旦大學(xué)中西醫(yī)結(jié)合一級學(xué)科國家重點學(xué)科，由中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)和中西醫(yī)結(jié)合臨床這兩個國家重點學(xué)科所組成。中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)學(xué)科博士點(1981年首批獲準(zhǔn))，是全國最早開展中西醫(yī)結(jié)合針刺原理研究的單位之一;1983年成為世界衛(wèi)生組織（WHO）傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)合作中心；1989年起成為全國第一批國家重點學(xué)科。該學(xué)科在開展中西醫(yī)結(jié)合針刺研究方面，研究內(nèi)容較集中，科研水平較高，在國內(nèi)外具有優(yōu)良聲譽。復(fù)旦大學(xué)中西醫(yī)結(jié)合臨床學(xué)科也是全國首批博士點，由華山醫(yī)院、中山醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、兒科醫(yī)院和婦產(chǎn)科醫(yī)院這五所附院的中西醫(yī)結(jié)合科室組成。早在1961年由沈自尹院士成立臟象研究室; 1985年成立中西醫(yī)結(jié)合研究所。該學(xué)科具有基礎(chǔ)扎實，覆蓋面廣，專科性強，支撐條件好的優(yōu)勢。2002年復(fù)旦大學(xué)即成為全國高校中唯一擁有這兩個重點學(xué)科的單位,并組成上海醫(yī)學(xué)院中西醫(yī)結(jié)合系。2007年通過全國重點學(xué)科考評后，成為中西醫(yī)結(jié)合一級學(xué)科國家重點學(xué)科。
本學(xué)科的主要研究方向：①腎本質(zhì)研究及其在內(nèi)科、婦科病方面的臨床應(yīng)用;②中西醫(yī)結(jié)合的代謝病研究;③中西醫(yī)結(jié)合腫瘤學(xué)研究;④特發(fā)性性早熟發(fā)病的病因及中醫(yī)藥治療機理研究;⑤中西醫(yī)結(jié)合神經(jīng)病學(xué)研究;⑥中西醫(yī)結(jié)合針刺效應(yīng)的機制研究。醫(yī)學(xué)全在線www.med126.com
本學(xué)科經(jīng)過長期積累，不斷開拓創(chuàng)新，形成了自身的研究特色，并取得了顯著的成果。本一級學(xué)科的多個研究方向如腎本質(zhì)研究、針刺原理研究、婦科、兒科、腫瘤科的相關(guān)研究等，均有長期的積累，研究基礎(chǔ)深厚扎實，因而，具有厚積薄發(fā)的可持續(xù)發(fā)展能力，在國內(nèi)外均有一定的影響。同時在實踐中已經(jīng)開拓了新的研究方向，如代謝病的“氣聚”理論及神經(jīng)病學(xué)研究等，這就進(jìn)一步豐富了一級學(xué)科的內(nèi)涵。多年來先后承擔(dān)國家973課題、國家自然基金重點及面上課題等，數(shù)十次獲得國家級及省部級的成果表彰。
中西醫(yī)結(jié)合是中國醫(yī)學(xué)工作者的創(chuàng)舉，同時，現(xiàn)代醫(yī)學(xué)與傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)的整合也已形成世界性的趨勢。要堅持走國際化的道路，加強國際交流和合作，敢于在國際舞臺上顯示我們的成績。近年來，先后獲得多項美國國家衛(wèi)生研究院（NIH）國際合作研究基金，還與意大利、英國等開展合作研究;在國際SCI系列雜志上發(fā)表數(shù)十篇學(xué)術(shù)論文，引起國內(nèi)外的興趣和重視。
本學(xué)科現(xiàn)有中國科學(xué)院院士一名，國務(wù)院學(xué)位委員會學(xué)科評議組召集人一名，中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會副會長一名，還有全國性學(xué)會各專業(yè)委員會的負(fù)責(zé)人多名。
本學(xué)科的博士生培養(yǎng)在國內(nèi)一直負(fù)有盛名。在歷年的全國百篇優(yōu)秀博士學(xué)位論文評審中，包攬了中西醫(yī)結(jié)合一級學(xué)科迄今為止的三篇優(yōu)秀博士論文; 還培養(yǎng)全國優(yōu)秀博士后一名。