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南京中醫(yī)藥大學第一臨床醫(yī)學院原名南京中醫(yī)學院中醫(yī)系，成立于1958年，1984年由原中醫(yī)系中醫(yī)臨床部分和原西基部西醫(yī)臨床部分重組成新的中醫(yī)系。1995年更名為南京中醫(yī)藥大學第一臨床醫(yī)學院，2001年將原中醫(yī)研究院急難癥研究室并入，又稱為臨床醫(yī)學研究所。
長期以來，在校黨政領導的領導下，在全體教職工的共同努力下，學院得到了長足的發(fā)展。第一臨床醫(yī)學院現(xiàn)設有中醫(yī)內(nèi)科學第一教研室（心、肺、腫瘤）、中醫(yī)內(nèi)科學第二教室（肝膽、脾胃）、中醫(yī)內(nèi)科學第三教研室（腎、內(nèi)分泌、風濕）、中醫(yī)外科學、西醫(yī)外科學、中醫(yī)肛腸病學、中醫(yī)皮膚科學、中醫(yī)婦科學、男科與生殖醫(yī)學、中醫(yī)兒科學、中醫(yī)骨傷科學、中醫(yī)眼科學、中醫(yī)耳鼻喉科學、西醫(yī)診斷學、影像學、西醫(yī)內(nèi)科學、全科醫(yī)學等17個教研室，另有1個為教學、科研服務的百草堂中醫(yī)門診部。
第一臨床醫(yī)學院秉承南中醫(yī)悠久的人文傳統(tǒng)，深邃的學術思想和深厚的文化底蘊，順應中國經(jīng)濟發(fā)展與中、西醫(yī)發(fā)展的潮流，開拓中、西醫(yī)臨床學科全面發(fā)展的教育格局。有中醫(yī)內(nèi)科學、中醫(yī)外科學、中醫(yī)婦科學、中醫(yī)兒科學、中醫(yī)骨傷科學、中醫(yī)五官科學和中西醫(yī)結合臨床7個博士點、7個碩士點，博士、碩士點覆蓋所有中醫(yī)臨床二級學科；能接受中醫(yī)和中西醫(yī)結合臨床各專業(yè)方向的博士后科研流動人員。在校博士研究生134名，碩士研究生587名，博士后人員3名。
學院現(xiàn)有中醫(yī)學七年制（本、碩連讀）、中西醫(yī)臨床醫(yī)學、中醫(yī)學（臨床醫(yī)學）、中醫(yī)學（全科醫(yī)學）、中醫(yī)學（眼視光學）、中醫(yī)學（骨傷科學）、中醫(yī)學（中西醫(yī)結合生殖醫(yī)學）、中醫(yī)學（中西醫(yī)結合影像學）等專業(yè)或?qū)I(yè)方向。在校本科和七年制學生1180名，其中中醫(yī)學七年制275名，中醫(yī)學（臨床醫(yī)學、全科醫(yī)學、中西醫(yī)結合生殖醫(yī)學、眼視光學）807名，中西醫(yī)臨床醫(yī)學98名。
第一臨床醫(yī)學院是以中醫(yī)臨床各學科為主的集教學、科研和臨床醫(yī)療為一體的教學單位。學院師資力量雄厚，隊伍結構合理，現(xiàn)有教職工107人，其中教師98人。教授、主任醫(yī)師、研究員30人，副教授、副主任醫(yī)師、副研究員34人。35歲以下教師30人，35～45歲30人，46～55歲27人，55歲以上11人。博士33人，碩士39人。學院還建立了一支由附屬醫(yī)院、鼓樓醫(yī)院、軍區(qū)總院、南京大學等教授組成的兼職教師隊伍。
全院上下開拓進取，嚴謹治學，唯善唯精，涌現(xiàn)了一批在省內(nèi)外享有較高聲譽的專家，現(xiàn)有享受國務院特殊津貼專家2人；全國名中醫(yī)2人；江蘇省名中醫(yī)、名中西醫(yī)結合專家5人；江蘇省“333”工程培養(yǎng)對象3人，江蘇省“青藍工程” 學術帶頭人培養(yǎng)人選3人，江蘇省“青藍工程”優(yōu)秀青年骨干教師培養(yǎng)人選6人；擔任全國和江蘇省中醫(yī)學會、中西醫(yī)結合學會的主要負責人的教師35人。有全國勞動模范汪受傳教授；全國優(yōu)秀教師潘立群教授等杰出教師代表。博士生導師13名，碩士生導師32名。
學院擁有重點學科3個，其中中醫(yī)兒科學為國家級重點學科和國家中醫(yī)藥局重點學科建設單位，是目前全國唯一的中醫(yī)兒科學國家級重點學科；中醫(yī)內(nèi)科學為江蘇省省級重點學科、江蘇省國家重點學科培育點和國家中醫(yī)藥局重點學科建設單位；中醫(yī)外科學系為南京中醫(yī)藥大學重點學科。中醫(yī)學專業(yè)為江蘇省首批品牌專業(yè)。中醫(yī)兒科學為國家精品課程，中醫(yī)內(nèi)科學、中醫(yī)兒科學、中醫(yī)外科學為江蘇省一類優(yōu)秀課程，中醫(yī)婦科學、中醫(yī)耳鼻咽喉科學為江蘇省二類優(yōu)秀課程，醫(yī)學全在.線網(wǎng)站gydjdsj.org.cn
中醫(yī)骨傷科學、西醫(yī)內(nèi)科學校級優(yōu)秀課程。近三年承擔教育部、國家中管局教育教學改革課題8項，江蘇省教育廳教改課題20項。獲教育教學獎25項，部省級4項，廳局級6項。學院教學實驗中心（模擬醫(yī)院）為江蘇省高等學校實驗室評估驗收首批合格單位、江蘇省省級示范教學實驗中心。
第一臨床醫(yī)學院堅持科研與教學相長的策略，科研總體水平良好，在科技成果轉(zhuǎn)化為現(xiàn)實生產(chǎn)力方面做了較大努力，取得了一定的社會效益和經(jīng)濟效益。全院教師潛心治學，學術氛圍濃厚，碩果累累。近三年承擔廳、局級以上科研課題83項，其中國家級6項，部、省級15項，課題經(jīng)費740萬元；完成并鑒定或結題驗收課題18項；獲專利17項；橫向課題10項，經(jīng)費達1293萬元；正式出版學術專著近67部；在省級以上雜志公開發(fā)表學術論文720篇；獲各級科研獎10項，其中中華醫(yī)學會科學技術獎2項，江蘇省科技進步獎6項，南京市科技進步獎2項，科研成果促教學成效顯著。
第一臨床醫(yī)學院今后將按“有所為，有所不為”的建設發(fā)展方針，凝煉方向，突出重點，優(yōu)化結構，培育特色，重在創(chuàng)新。確立以育人為中心，教學、科研為主體的工作總目標，保證學院各項事業(yè)和諧、健康、可持續(xù)發(fā)展。建章立制，規(guī)范管理；加強師資隊伍建設，建立一支數(shù)量相當、結構合理、素質(zhì)優(yōu)良、相對穩(wěn)定的教師隊伍；圍繞培養(yǎng)優(yōu)質(zhì)的能夠適應市場需求的中醫(yī)藥高級人才，加強專業(yè)、教材建設，優(yōu)化課程設置，改進教學方法，強化實驗室及教學輔助設施建設；以重點學科建設為籠頭，加強科學研究，提升我院的整體競爭力，促進醫(yī)、教、研三位一體的協(xié)同發(fā)展。
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