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1978年 全國(guó)恢復(fù)研究生教育工作，我校為第一批招收碩士研究生單位。
1978年 恢復(fù)了夜大招生。形成了在校教育、畢業(yè)后教育，繼續(xù)教育的完整三個(gè)階段體系。
1979年3月10日 省政府任命王季午為浙江醫(yī)科大學(xué)校長(zhǎng)。
1980年國(guó)務(wù)院頒布《中華人民共和國(guó)學(xué)位條例》。1981年 我校被批準(zhǔn)為首批博士和碩士學(xué)位授予單位。
1981年8月l4日省委任命戴迪、金干為副校長(zhǎng)。
1982年11月23日 省委又任命戴迪、劉秀華為副書(shū)記。
從1978年到1982年的六年中，學(xué)校處于"文革"后的恢復(fù)重建時(shí)期，各系修訂教學(xué)大綱，編寫(xiě)教學(xué)實(shí)驗(yàn)和實(shí)習(xí)指導(dǎo)書(shū)，開(kāi)展教學(xué)內(nèi)容和方法的改革，以培養(yǎng)學(xué)生分析問(wèn)題和解決問(wèn)題的能力。并組織有經(jīng)驗(yàn)的教師、醫(yī)師上教學(xué)、醫(yī)療工作的第一線。由于采取上述一系列措施，教學(xué)、醫(yī)療質(zhì)量不斷提高，在衛(wèi)生部組織的全國(guó)部分醫(yī)學(xué)院校醫(yī)學(xué)系畢業(yè)生的統(tǒng)考中，l982年與1983年均獲第二名，1984年獲第一名。
1983年 開(kāi)始為石油部代培臨床醫(yī)學(xué)系五年制學(xué)生。學(xué)生來(lái)源為全國(guó)各大油田所在地區(qū)的應(yīng)屆高中畢業(yè)生，經(jīng)全國(guó)高校統(tǒng)一招生考試。是年秋，首批石油部新生60名入學(xué)。
1984年1月 浙江省省委任命金干為校黨委書(shū)記，鄭樹(shù)、劉秀華為副書(shū)記；任命鄭樹(shù)為校長(zhǎng)，金干、丁德云、姚竹秀、沈成芳為副校長(zhǎng)，王季午教授為名譽(yù)校長(zhǎng)。接著，對(duì)系、部，處室和附屬醫(yī)院的黨政領(lǐng)導(dǎo)班子進(jìn)行了調(diào)整充實(shí)。
1984年 創(chuàng)建臨床醫(yī)學(xué)工程系，學(xué)制三年。秋，30名新生入學(xué)。1986年 學(xué)制改為五年 招生數(shù)同前。
1986年 恢復(fù)公共衛(wèi)生系，學(xué)制五年。是年秋，30名新生入學(xué)。
1986年 調(diào)整和新建12個(gè)研究所，即：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所、傳染病研究所、腫瘤研究所、心腦血管病研究所、環(huán)境與健康研究所、老年醫(yī)學(xué)研究所、血液病研究所、計(jì)劃生育研究所、臨床藥理研究所、藥物研究所、人口研究所和醫(yī)學(xué)教育研究所。
1985年8月 醫(yī)學(xué)營(yíng)養(yǎng)系招生，學(xué)制5年。
1986年10月 召開(kāi)了學(xué)校第五屆黨代會(huì)。出席代表260名。選舉金干為黨委書(shū)記，鄭樹(shù)、劉秀華、陳昭典為黨委副書(shū)記。
1987年10月 19層三號(hào)教學(xué)大樓正式開(kāi)工。1991年8月，高72米建筑面積21000平方米，耗資2300萬(wàn)元的19層三號(hào)教學(xué)大樓竣工投入使用。
1987年12月8日 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院與學(xué)校決定以我校12個(gè)研究所為實(shí)體，建立中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院浙江分院。鄭樹(shù)任分院院長(zhǎng)，丁德云任分院副院長(zhǎng)。
1987年冬，籌建護(hù)理系，在護(hù)校畢業(yè)并具有三年以上臨床實(shí)踐的優(yōu)秀護(hù)士中招生，學(xué)制三年。次年秋，30名新生入學(xué)。
1988年 國(guó)家教委決定在全國(guó)15所醫(yī)學(xué)院校中試辦七年制高等醫(yī)學(xué)教育，我校也在其中之列。1988年秋，首屆七年制臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)22名新生入學(xué)。七年制學(xué)生，頭二年委托浙江大學(xué)培養(yǎng)，使其受到足夠的理科基礎(chǔ)、現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)技術(shù)和外語(yǔ)等的訓(xùn)練，第三年回校本部繼續(xù)醫(yī)學(xué)課程和臨床學(xué)科的學(xué)習(xí)。
1989年 香港著名實(shí)業(yè)家邵逸夫爵土捐資7000萬(wàn)港元，后又捐贈(zèng)400萬(wàn)美元購(gòu)置醫(yī)療設(shè)備，在杭州籌建綜合醫(yī)院作為學(xué)校附屬醫(yī)院。命名為"邵逸夫醫(yī)院"。1994年5月，竣工開(kāi)診。該醫(yī)院建成后，最初五年由美國(guó)羅馬琳達(dá)(Loma Linda)大學(xué)醫(yī)學(xué)院、醫(yī)學(xué)中心協(xié)助管理，1999年移交中方管理。
1991年3月 成立浙江醫(yī)科大學(xué)兒科研究所
1991年3月 中共浙江省委任命呂世亭為黨委書(shū)記，副校長(zhǎng)。
1992年1月 在原校中心實(shí)驗(yàn)室改建的基礎(chǔ)上，建立醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室。面向全省開(kāi)放，為省級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。
1992年６月 學(xué)校第六屆黨代會(huì)選舉并經(jīng)中共浙江省委批準(zhǔn)任命呂世亭為黨委書(shū)記，鄭樹(shù)、劉秀華、水泉祥為副書(shū)記；任命鄭樹(shù)為校長(zhǎng)，呂世亭，丁德云、陳昭典、章鎖江、高法根為副校長(zhǎng)。
1993年5月 經(jīng)浙江省教委批準(zhǔn)，成立浙江醫(yī)科大學(xué)成人教育學(xué)院。設(shè)有成人學(xué)歷教育、畢業(yè)后教育、繼續(xù)教育、崗位培訓(xùn)等。
1993年10月 成立第一臨床醫(yī)學(xué)院（醫(yī)學(xué)一系、護(hù)理系、兒科學(xué)）、第二臨床醫(yī)學(xué)院（醫(yī)學(xué)二系、營(yíng)養(yǎng)系、婦產(chǎn)科系）和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院。
1994年 開(kāi)始招收臨床醫(yī)學(xué)系兒科專業(yè)
1994年12月 成立婦產(chǎn)科學(xué)、兒科學(xué)和生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)研究所。
1994年10月 決定成立浙江醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院。下設(shè)預(yù)防醫(yī)學(xué)系、婦幼衛(wèi)生系、衛(wèi)生管理系、衛(wèi)生檢測(cè)中心。
1996年 教育部批準(zhǔn)浙江醫(yī)科大學(xué)成立“國(guó)家理科人才基地”。
1996年８月 正式成立兒科系
1996年10月23日 中共浙江省委任命黃書(shū)孟為浙江醫(yī)科大學(xué)黨委書(shū)記，李蘭娟、李魯、為副書(shū)記。
1996年10月29日 浙江省人民政府任命陳昭典為浙江醫(yī)科大學(xué)校長(zhǎng)。黃書(shū)孟、水泉祥、章鎖江、來(lái)茂德、余海為副校長(zhǎng)，后又增補(bǔ)王珉元為副校長(zhǎng)。
1996年11月國(guó)家教育委員會(huì)成為“基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)國(guó)家理科人才培養(yǎng)基地”，于1998年開(kāi)始招生基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)專業(yè)的第一屆學(xué)生。
1997年 開(kāi)始籌建基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)專業(yè)。
1997年5月 通過(guò)省政府重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目的可行性論證，確定傳染病學(xué)、腫瘤學(xué)、醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)、勞動(dòng)衛(wèi)生與職業(yè)病學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、外科學(xué)、藥理學(xué)為七個(gè)重點(diǎn)學(xué)科。省人民政府決定，從1997年起五年內(nèi)投入6000萬(wàn)元人民幣（學(xué)校自籌6000萬(wàn)元，共計(jì)1.2億元），用于浙江醫(yī)科大學(xué)的重點(diǎn)學(xué)科項(xiàng)目建設(shè)。
1997年12月 撤消原藥學(xué)系建制，成立浙江醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院。下設(shè)藥學(xué)系、藥劑系、成教部。
1998年 組建基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)醫(yī)學(xué)專業(yè)并開(kāi)始招生。
1998年 國(guó)家教委批準(zhǔn)病毒性傳染病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室設(shè)立博士后流動(dòng)站
五、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院
1998年9月15日 根據(jù)國(guó)務(wù)院指示，浙江大學(xué)、杭州大學(xué)、浙江農(nóng)業(yè)大學(xué)、浙江醫(yī)科大學(xué)合并組建成立新浙江大學(xué)。
1999年7月 組建成立醫(yī)學(xué)院。聘請(qǐng)中國(guó)科學(xué)院院士、中國(guó)人民解放軍第二軍醫(yī)大學(xué)陳宜張教授為醫(yī)學(xué)院院長(zhǎng)；任命李魯為常務(wù)副院長(zhǎng)；余海、鄭樹(shù)森、方理本、方平楚、姚耿東、張?zhí)K展為副院長(zhǎng)。同時(shí)任命李魯兼醫(yī)學(xué)院黨委書(shū)記、徐亮、趙金秀為副書(shū)記。
1999年8月18日 附屬口腔醫(yī)院暨浙江省口腔醫(yī)院成立。
1999年9月 學(xué)院在附屬一院組建成立浙江省器官移植重點(diǎn)研究實(shí)驗(yàn)室。
2000年９月起，臨床醫(yī)學(xué)停招五年制全部改招七年制（醫(yī)學(xué)碩士）學(xué)生，共計(jì)365名。
2001年 病毒性傳染病研究室被衛(wèi)生部列為重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。
2001年3月 衛(wèi)生部多器官聯(lián)合移植研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在附屬一院成立。
2001年11月 學(xué)校對(duì)醫(yī)學(xué)院黨政領(lǐng)導(dǎo)班子作了調(diào)整：姒健敏任常務(wù)副院長(zhǎng)，李魯（兼）、黃荷鳳、陳智、何超（兼）任副院長(zhǎng)。
2001年12月 鄭樹(shù)森當(dāng)選為中國(guó)工程院院士。
2002年1月 增補(bǔ)羅建紅為醫(yī)學(xué)院副院長(zhǎng)。
2002年6月18日學(xué)校黨委決定：陳智任中共浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院委員會(huì)委員、書(shū)記。
2002年8月 衛(wèi)生部批準(zhǔn)把病毒性傳染病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室更名為衛(wèi)生部傳染病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。
2003年4月 《全科醫(yī)學(xué)臨床與教育》雜志創(chuàng)刊。
2003年11月11日 學(xué)校決定陳宜張教授不再擔(dān)任醫(yī)學(xué)院院長(zhǎng)職務(wù)，同時(shí)任命巴德年教授為醫(yī)學(xué)院院長(zhǎng)。
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