復旦大學公共衛(wèi)生學院的歷史可追溯至1927年。中國著名醫(yī)學教育家、公共衛(wèi)生學家顏福慶于1927年創(chuàng)辦醫(yī)學院時，就非常重視公共衛(wèi)生的教學，次年7月在醫(yī)學院內(nèi)組建了公共衛(wèi)生科，并親任科主任兼公共衛(wèi)生教授，逐步開展疾病預防、環(huán)境衛(wèi)生和婦幼保健等工作。1928年，由胡宣明負責建立了“吳淞(今寶山區(qū))衛(wèi)生公所”作為公共衛(wèi)生教學實驗區(qū)，1929年9月與上海市衛(wèi)生局合作，改建為“吳淞衛(wèi)生模范區(qū)”，同時建立了“高橋(今浦東新區(qū))衛(wèi)生事務所”。
此后，歷經(jīng)抗戰(zhàn)直至解放，機構名稱數(shù)易，由公共衛(wèi)生科更名為公共衛(wèi)生學院、衛(wèi)生系等。先后擔任院系主任、院長的有蘇德隆、李穆生、顧學箕、俞順章、詹紹康、姜慶五等。
2000年4月上海醫(yī)科大學與復旦大學合并后，成立復旦大學公共衛(wèi)生學院。姜慶五任院長．郭紅衛(wèi)、徐勛、錢序、周志俊、陳文先后任副院長。傅華任黨委書記。毛惠琴、包江波先后任黨委副書 記。
公共衛(wèi)生學院在我國的疾病防治、預防保健及衛(wèi)生政策的決策工作中發(fā)揮了重要作用，涌現(xiàn)出一批國內(nèi)外知名的專家教授。
1956年起，蘇德隆任全國血吸蟲病防治委員會副主任兼預防組主任，4次受到毛澤東同志的接見。在蘇德隆的帶領下，通過實驗室研究和現(xiàn)場實踐相結合的方法，發(fā)現(xiàn)釘螺的分布規(guī)律，提出預防為主、防治結合的區(qū)域性防治血吸蟲病的科學理論。在這些理論的指導下，在血吸蟲病重災區(qū)上海青浦縣建立了“血吸蟲病試驗田”進行血吸蟲病的防治并加以推廣，1966年青浦縣消滅血吸蟲病，隨后在安徽、江西、湖南血吸蟲病防治和控制流行的實踐中也取得了顯著成效。1985年上海市宣布要消滅血吸蟲病。流行病學教研室篩選和推廣多種滅螺藥物、研制成“防蚴筆”等，在國內(nèi)和非洲索馬里的血吸蟲病流行區(qū)域應用取得了良好的效果，使疫區(qū)居民的血吸蟲病感染率和湖水釘螺的感染率迅速下降，對控制血吸蟲病的流行做出了重要貢獻。80年代，袁鴻昌對江湖洲灘地區(qū)血吸蟲病流行因素、規(guī)律和對策的研究，先后作為國家“七五”、“八五”攻關課題。學院對霍亂弧菌越冬機理與2號病發(fā)生發(fā)展關系的研究取得了重大突破。
1951年起，許世瑾等開展了對上海市的人口資料進行死亡率、出生率、期望壽命和年齡分布的統(tǒng)計分析工作，至60年代，對上海市人口進行了預測，為政府計劃生育政策提供了技術資料。
20世紀50年代中期開始，在防治職業(yè)病過程中，顧學箕等經(jīng)常組織師生下廠礦和農(nóng)村，通過現(xiàn)場衛(wèi)生學調(diào)查，結合實驗室研究，在防治和控制苯中毒、鉛中毒、農(nóng)藥中毒，改善生產(chǎn)環(huán)境包括高溫條件下工人的作業(yè)等方面均取得成效。通過廣泛的調(diào)查，發(fā)現(xiàn)了我國礦山企業(yè)工人中的矽肺問題，并提出了相應的參考標準。王摻蘭等負責的“工業(yè)鉛中毒研究”，在山東淄博蓄電池廠工業(yè)鉛中毒的研究中，通過現(xiàn)場調(diào)查、診斷、防治、建立實驗動物模型等方法揭曉了鉛中毒的機理，為我國防治工業(yè)鉛中毒做出了貢獻，獲1986年衛(wèi)生部科技進步甲等獎。
同時期，徐達道等通過對河南、安徽等省的調(diào)查，發(fā)現(xiàn)了赤霉病麥的病原菌、感染途徑、分布區(qū)域、預防措施、處理方法等。至80年代初，嚴文鈺等開展了輻照食品的研究，先后對大米、洋蔥、土豆、蘋果、牛肉干、香腸等輻照后的食品進行了動物試驗和120余人的人群試驗，為國家和平利用原子能進行食品保藏提供了技術數(shù)據(jù)和科技標準。
同時期，楊銘鼎等開展了上海市環(huán)境質(zhì)量包括大氣、水體和土壤的衛(wèi)生研究，對上海市空氣污染、飲水中致突變物質(zhì)的研究，調(diào)查了環(huán)境污染的源頭、途徑等，提出了大氣污染的解決方案，上海市區(qū)居民飲用水臨江取水口的合理位置，大氣質(zhì)量評估的方法等，為市政府實現(xiàn)城市煤氣化以及黃浦江上游引水取水口選擇的決策提供了科學依據(jù)。
1981年，根據(jù)中美兩國衛(wèi)生部醫(yī)藥衛(wèi)生科技合作議定書“中美衛(wèi)生服務研究合作項目”中的條款，學院與美國霍普金斯大學公共衛(wèi)生學院進行科技合作，對中國上�？h和美國華盛頓縣的衛(wèi)生服務做了對比研究。1981年7月在上海召開工作研討會．，美國助理衛(wèi)生部長布來恩特(J．Bryant)博士等6位專家到會，根據(jù)對第一手資料的科學分析，美方對我國衛(wèi)生工作的方針政策、三級醫(yī)療保健網(wǎng)、合作醫(yī)療制度和上海縣的衛(wèi)生服務，給予了較高的評價。上海縣的人口預期壽命從1950年的44．7歲提高到1980年的72.4歲，30年人均壽命提高了27.7歲，而美國1900年的49.2歲提高到1980年的73.2歲經(jīng)過了80年才提高24歲。上�？h1980年人口出生率為14．8‰。，而美國是16.3‰。上�？h1980年的人口死亡率為6.2‰，而美國為9.5‰。1982年在華盛頓舉行的中美聯(lián)合委員會會議上，美方對這項合作深表滿意，認為中國的經(jīng)驗值得學習借鑒，調(diào)查結果的20多篇論文在1982年及1983年先后在《上海第一醫(yī)學院學報》(增刊)及美國公共衛(wèi)生雜志上專輯發(fā)表。學院與上�？h聯(lián)合拍攝的《上海縣初級衛(wèi)生保健>>系列電視教學片，得到了世界衛(wèi)生組織的高度贊揚，并向其他國家推薦。通過合作研究，有關人員業(yè)務上得到了培訓和提高，促進了衛(wèi)生事業(yè)的發(fā)展，上海縣由此提前達到WH()提出的“2000年人人享有健康保健”的衛(wèi)生目標。
1988年，上海市甲型肝炎(甲肝)爆發(fā)流行，患病30萬人。徐志一等深入防治第一線，在以往病毒性肝炎研究的基礎上，對這次甲肝爆發(fā)流行規(guī)律、臨床特征、病毒檢測技術以及甲肝流行對上海市經(jīng)濟發(fā)展的影響等方面進行了專題研究。調(diào)查了近3萬例毛蚶食用者，獲得了毛蚶傳播這次甲肝爆發(fā)的血清流行病學證據(jù)，應用核酸分子雜交、細胞培養(yǎng)、絨猴感染實驗等研究，獲得毛蚶傳播這次甲肝爆發(fā)的病原學證據(jù)。李子華等運用分子生物學方法分析了一株從毛蚶分離到的甲肝病毒核酸序列，為我國首次提出了甲肝病毒基因分析圖譜。這些研究成果，為上海市政府禁止毛蚶上市和食用提供了科學依據(jù)，及時控制了甲肝爆發(fā)的流行，并獲1991年國家科技進步三等獎項。
我國肝癌高發(fā)地區(qū)的預防研究上，蘇德隆、俞順章、顧杏元等深人高發(fā)區(qū)域，用流行病學理論和方法，對肝癌高發(fā)因素進行系統(tǒng)研究，提出了飲水污染、黃曲霉毒素污染、病毒性肝炎是肝癌高發(fā)的主要因素的理論，采用“管水、管糧、防肝炎”的七字方針進行預防。經(jīng)過不斷的實踐和研究，肝癌高發(fā)因素的理論和預防措施被過過同行認可和接受。
社會醫(yī)學和衛(wèi)生事業(yè)管理學是20世紀80年代發(fā)展起來的一門新興學科。李婉先、顧杏元、龔幼龍、胡善聯(lián)、郝模等針對我國的實際情況，開展軟課題包括“衛(wèi)生政策”、“衛(wèi)生資源使用及效益”、“控制醫(yī)療費用增長”、“農(nóng)村合作醫(yī)療制度”、“衛(wèi)生事業(yè)改革途徑與效果”、“總量控制、結構調(diào)整政策評價課題”和“1995—2010年上海市衛(wèi)生人力發(fā)展戰(zhàn)略研究”等研究。
20世紀80年代起，學院與美國哈佛大學公共衛(wèi)生學院、霍普金斯大學、瑞典烏米爾大學等國際知名大學建立了校際學術交流聯(lián)系。
近年間，公共衛(wèi)生學院圍繞保障人群健康，控制重大疾病的目標和需求，在長期的科研與教學活動中，形成了“重大疾病的流行規(guī)律與控制”、“環(huán)境醫(yī)學與衛(wèi)生毒理學”、“人口健康與健康行為學”、“社區(qū)醫(yī)學與衛(wèi)生服務”、“衛(wèi)生政策與管理”5個主要研究方向。
“重大疾病的流行規(guī)律與控制”研究方向在重大疾病和突發(fā)疾病的控制技術、惡性腫瘤等疾病的病因學研究、生物標記物在疾病防治中的作用、遺傳因素在肝癌等腫瘤發(fā)生中的作用等研究領域達到國際前沿水平。如徐志一教授主持的“規(guī)范化甲肝減毒活疫苗保護效果及免疫策略研究”成果獲2002年國家科技進步二等獎。
“環(huán)境醫(yī)學與衛(wèi)生毒理學”研究方向，近年在大氣污染與健康關系危險度評定、水藻類毒素的毒性與污染控制、苯與白血病的關系、環(huán)境鎘污染與健康關系、遺傳背景與重要工業(yè)毒物對健康影響的交互作用等方面獲得多渠道經(jīng)費(如國家“863”、“973”、國際合作等)的支持，開展了深入的研究。俞順章教授主持的“主要淡水藻類(藍藻)毒素危害健康機理及預防對策研究”獲2002年上海市科技進步一等獎。
“人口健康與健康行為學”研究方向在國內(nèi)高校首次開設循證衛(wèi)生保健導論、艾滋病健康社會科學和同性戀健康社會科學研究生課程，受到好評；青少年生殖健康相關研究成果已列為世界衛(wèi)生組織出版物；循證婦幼保健相關研究成果已被國內(nèi)外同行認可并多次引用。
“社區(qū)衛(wèi)生與衛(wèi)生服務”研究方向在形成疾病預防控制體系、社區(qū)衛(wèi)生服務等領域取得了比較好的研究成果。由CMB資助項目“慢性病自我管理”被世界衛(wèi)生組織采納為良好疾病管理案例“example of best practices”向全球推廣，主持研究的上海市醫(yī)學重大課題“腦卒中社區(qū)防治優(yōu)化方案”成果為上海市腦卒中社區(qū)防治提供了科學依據(jù)；在衛(wèi)生服務研究方面，主持研究的農(nóng)村醫(yī)療保障等成果成為政府決策的重要依據(jù)。
進入2l世紀，本學科的發(fā)展邁人新的階段。其中，流行病學與衛(wèi)生統(tǒng)計學、勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學兩個學科進入復旦大學“985工程”一期重點學科建設，在“十五”、“211工程”建設中，籌建了“教育部公共衛(wèi)生安全重點實驗室”，2003年11月被批準為教育部立項建設的重點實驗室。2004年衛(wèi)生部批準成立“衛(wèi)生部衛(wèi)生技術評估重點實驗室”。2004年教育部高等學校與科研院所學位與研究生教育評估所對全國各學位授予單位的一級學科的整體水平進行排名，復旦大學名列全國公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學一級學科的榜首，公共管理(含社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理)列全國一級學科排名第二。公共衛(wèi)生學院學科的綜合實力和特色優(yōu)勢獲得進一步發(fā)展。
其一，以國家重大公共衛(wèi)生問題作為研究重點，在農(nóng)藥的毒性、重金屬對健康的影響、血吸蟲病的控制、肝炎流行病學、肝癌的病因研究、結核病的流行病學研究、SARS與流感控制研究方面都取得了一定的成果，在國家和地區(qū)的疾病預防和控制過程中發(fā)揮了積極和重要的作用。．如2002年2月本學科的李子華、居麗雯兩位專家應衛(wèi)生部邀請，參加在廣東的“非典”調(diào)查。俞順章、姜慶五作為上海市“非典”控制專家組的成員，為上海市的SARS控制做出了一定貢獻，受到上海市政府的表彰。
其二，科研實力不斷提升，國際間合作發(fā)展迅速。自2001年以后獲得的科研經(jīng)費共計4486.9萬元，承擔“973”課題l項，主持“863”子課題l項；共同主持自然科學基金重點課題1項，自然科學基金課題12項；主持上海市重大課題l項；國際合作課題29項，在核心期刊上發(fā)表論文157篇，SCI收錄論文49篇，EI收錄論文15篇，出版專著34本。綜合預防醫(yī)學各學科有優(yōu)勢的教育部公共衛(wèi)生安全重點實驗室已經(jīng)在2004年6月通過立項檢查。
其三，中青年教師成長迅速，已形成了以中青年學者為主體的教學與研究群體。學院教師隊伍中有國家杰出青年基金獲得者、上海市青年精英郝模教授，上海市曙光計劃學者周志俊教授。上海市啟明星屈衛(wèi)東教授，復旦大學世紀之星屈衛(wèi)東、何納、張文彤、施瑋、陳文、羅力、傅東波、穆麗娜。副教授以上的學者，全部都有在國外學習一年以上的經(jīng)歷。目前，學科正在形成以40歲左右的骨干教師為主導的教學科研隊伍。每一位教授都有自己的研究方向和實驗室支持，其研究主要分布在重要傳染病與重大的慢性病控制、重要環(huán)境污染物的危害健康機制、食品安全、社區(qū)人群疾病的預防和保健等方面。
其四．始終為國家培養(yǎng)大批高質(zhì)量的預防醫(yī)學和衛(wèi)生管理高層次人才。2001年后畢業(yè)的本科生501名．畢業(yè)生就業(yè)率99.6％，授予碩士學位206名．授予博士學位95名。每年招收本科生100名左右、碩士研究生50名左右、公共衛(wèi)生碩士5()名左右、博士研究生20名左右。
1999—2004年年全國共評出4篇預防醫(yī)學與公共衛(wèi)生的優(yōu)秀博士學位論文．其中2篇出自復旦大學公共衛(wèi)生學院(宋鍵獲1999年全國優(yōu)秀博士學位論文獎，蔡琳獲2001年全國優(yōu)秀博上學位淪文獎，導師分別為葉舜華、洪傳潔、俞順章)。學院的社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理為國家重點學科．預防醫(yī)學為一級學科博士授予單位。學院設6個碩士點，分別是流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學、勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學、少兒衛(wèi)生與婦幼保健學、衛(wèi)生毒理學、社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理。4個博士點，分別是流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學、勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學、社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理。2個博士后流動站，分別是公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、公共管理。另設預防醫(yī)學研究所、世界衛(wèi)生組織(上海)職業(yè)衛(wèi)生合作中心、衛(wèi)生部衛(wèi)生技術評估重點實驗室等科學研究機構；共有流行病學、勞動衛(wèi)生與職業(yè)病學、環(huán)境衛(wèi)生學、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學、少兒衛(wèi)生學、衛(wèi)生統(tǒng)計與社會醫(yī)學、預防醫(yī)學、衛(wèi)生微生物學、衛(wèi)生化學、健康教育學、婦幼衛(wèi)生學、衛(wèi)生事業(yè)管理學、衛(wèi)生經(jīng)濟學、醫(yī)院管理學、衛(wèi)生監(jiān)督與衛(wèi)生法學15個教研室。2004年，在院本科生543名，博士研究生95名，碩士研究生273名，公共衛(wèi)生碩土專業(yè)學位116名。學院有教授20人(校特聘教授1人)，副教授22人。有7名教師獲得上海市優(yōu)秀青年教師獎、上海市育才獎和華藏獎等校級以上各項教育榮譽獎，6名教師獲得優(yōu)秀教師工作者稱號。
學院設置預防醫(yī)學和公共事業(yè)管理2個本科專業(yè)。預防醫(yī)學專業(yè)學制五年，主要培養(yǎng)具有扎實醫(yī)學知識從事疾病預防控制、衛(wèi)生監(jiān)督、衛(wèi)生行政工作和預防醫(yī)學教學、科研工作的高級人才。公共事業(yè)管理專業(yè)學制四年，主要培養(yǎng)既掌握現(xiàn)代管理手段，具有公共事業(yè)領域的專業(yè)知識，又具有管理技能的公共衛(wèi)生事業(yè)的復合型人才。學院為本科生共開設了39門專業(yè)必修課程、19門專業(yè)選修課程和38門公共選修課程。已主編《流行病學》、《醫(yī)學營養(yǎng)》、《衛(wèi)生經(jīng)濟》、《職業(yè)衛(wèi)生與職業(yè)醫(yī)學》等教材，共有11門課程采用學院主編的教材，其中3門課程的教材為國家重點教材，5門為部屬重點教材，2門為面向21世紀教材， 從顧學箕教授始主編各版《預防醫(yī)學》，傅華教授授主編的《預防醫(yī)學》 獲得2005年全國高等學校醫(yī)藥優(yōu)秀教材三等獎、龔幼龍教授主編的《社會醫(yī)學》和程曉明主編的《衛(wèi)生經(jīng)濟》被評為優(yōu)秀教材。趙根明教授主講的流行病學課程被評為復旦大學精品課程 ，傅華教授主講的臨床預防醫(yī)學課程被評為上海市精品課程，錢序教授主講的生殖健康與進展課程采用雙語教學的方式取得了良好效果。
學院與上海市及多家區(qū)級疾控制中心和衛(wèi)生監(jiān)督所等實習基地建立了長期、穩(wěn)定的良好合作關系，為學生提供寶貴的實習機會。